从 Mac/Linux 上的 R 连接到 MS SQL Server



我正在尝试从 Mac/Linux 上的 R 连接到 Microsoft SQL Server,但我在使用 RJDBC 时遇到了问题。当我下载了Microsoft的驱动程序和JTDS时,但以下行都不起作用:

library(RJDBC)
drv <- JDBC("com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver",
            "/Users/victor/Downloads/sqljdbc_3.0/enu/sqljdbc4.jar") 
drv1 <- JDBC('net.sourceforge.jtds.jdbc.Driver',
           "/Users/victor/Downloads/jtds-1/jtds-1.3.0.jar")

每个都返回以下错误消息:

Error in .jfindClass(as.character(driverClass)[1]) : class not found

我怀疑问题可能出在错误的 Java 版本上:我的默认 java 是

$ java -version
java version "1.7.0_11"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_11-b21)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.6-b04, mixed mode)

但我的机器上也安装了 Java 1.6。我安装了SquirrelSQL,它使用JTDS驱动程序连接到MS SQL Server没有任何问题;SquirrelSQL运行的Java版本是1.7.0.11。

我运行了R CMD javareconf,结果如下:

$ R CMD javareconf
Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.7.0_11
Java home path   : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_11.jdk/Contents/Home/jre
Java compiler    : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
Java library path: 
JNI linker flags : -framework JavaVM
JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/include
Updating Java configuration in /Library/Frameworks/R.framework/Resources
Done.

并再次删除/安装了 RJDBC 和 rJava 包,但仍然没有任何效果。

我想我现在被困住了,因为我对Java/RJDBC和它们的交互不是很熟悉。搜索谷歌发现有几个人有类似的问题,但没有解决方案。

任何关于如何使JDBC行为的提示,或任何其他从R连接到MS SQL Server的方法,将不胜感激!

更新 1.好吧,第一个语句现在似乎有效 - 我正在连接并且可以毫无问题地查询数据库。不确定是什么解决了问题 - 可能是我需要重新启动我的 mac/R 会话。第二条语句仍然不起作用,并显示相同的错误消息。

我已经为此苦苦挣扎了一段时间。这是我的发现。

  1. 从这里下载 -- Microsoft 适用于 SQL 服务器的 JDBC 驱动程序
  2. 解压缩文件,您可以在其中找到sqljdbc4.jar .
  3. 用:

    drv <- JDBC("com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver", "<wherever sqljdbc4.jar is>")
    

这应该有效。

如果我是对的,这个想法是,对于drv函数中的PATH变量,需要指定 JDBC 驱动程序所在的 PATH(因此,如果没有,则先下载它)。否则,将收到常见的class not find错误。

以下代码实现了从 Mac OS x 连接到 R 的目标。从此处Microsoft下载Microsoft JDBC 驱动程序

链接到 Github 中的 Gist/Code

# install.packages("RJDBC",dep=TRUE)
library(RJDBC)
drv <- JDBC("com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver" , "/Users/johndacosta/Downloads/sqljdbc_4.0/enu/sqljdbc4.jar" ,identifier.quote="`")
conn <- dbConnect(drv, "jdbc:sqlserver://192.172.1.210:55158;databaseName=master", "sa", "password")
d <- dbGetQuery(conn, "select * from sys.databases where database_id <= 4 ")
summary(d)

我在Linux上使用jtds-1.3.1时遇到了这个问题。当我尝试切换到jtds-1.2.7时,问题消失了。jtds-1.3.* 中似乎有一些东西使其与 RJDBC 不兼容。

我遇到了完全相同的问题。这是一个jTDS解决方案:

  1. 下载 jTDS 1.2.8 并解压缩。说它保存在~/Downloads/jtds-1.2.8-dist/jtds-1.2.8.jar.注意:其他版本可能无法正常工作!
  2. R,设置驱动程序:drv <- JDBC("net.sourceforge.jtds.jdbc.Driver", "~/Downloads/jtds-1.2.8-dist/jtds-1.2.8.jar")
  3. 设置连接对象:conn <- dbConnect(drv, "jdbc:jtds:sqlserver://servername:port;DatabaseName=databasename", domain="windows domain", user="user", password="pwd")

在这里,domain把事情搞砸了。你不能把domainusername作为你的user.您必须根据 jTDS 驱动程序实现单独定义它们。

 library(RJDBC) 
 cp <- c
 ( 
      "<usr path>/jdbc/mdb/log4j.jar", 
      "<usr path>/jdbc/mdb/commons_lang.jar", 
      "<usr path>/jdbc/mdb/commons_logging.jar" 
  ) 
 .jinit(classpath=cp) 
 drv <- JDBC("com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver",
        "/Users/victor/Downloads/sqljdbc_3.0/enu/sqljdbc4.jar") 

当我尝试使用 RJDBC 连接到 Cassandra 时,我之前也发生了同样的错误,通过将 Cassandra JDBC 依赖项放在 JAVA ClassPath 中来解决。

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