有一个很好的例子,如何使用ggplot2来创建一个热图'R;方法:Rheatmap,提供原始数据和源代码的链接。
有一个后续使用ggplot2: ggplot2,它列出了ggplot2代码。
在关键的地方,ggplot2代码使用了shape2和plyr。
nba.m <- melt(nba)
nba.m <- ddply(nba.m, .(variable), transform,rescale = rescale(value))
我的目标是使用tidyr和dplyr来复制这些计算。
nba.m <- melt(nba)
在
中有一个tidyr等价: nba.g <- gather(nba, Name)
与这一行等价的dplyr是什么?
nba.m <- ddply(nba.m, .(variable), transform,rescale = rescale(value))
eipi10善意建议
nba.m2 <- nba.m %>%group_by(Name) %>% mutate(rescale=rescale(value))
然而,看起来缩放计算不是以完全相同的方式发生的:
> head(nba.m)
Name variable value rescale
1 Dwyane Wade G 79 0.9473684
2 LeBron James G 81 0.9824561
3 Kobe Bryant G 82 1.0000000
4 Dirk Nowitzki G 81 0.9824561
5 Danny Granger G 67 0.7368421
6 Kevin Durant G 74 0.8596491
> head(nba.m2)
Source: local data frame [6 x 4]
Groups: Name
Name Name.1 value rescale
1 Dwyane Wade G 79 0.9634146
2 LeBron James G 81 0.9878049
3 Kobe Bryant G 82 1.0000000
4 Dirk Nowitzki G 81 0.9878049
5 Danny Granger G 67 0.8170732
6 Kevin Durant G 74 0.9024390
>
缺少什么?
谢谢,马特
我认为你应该写dplyr::mutate
,而不是mutate
。
我假定您在同一会话中加载了plyr
和dplyr
。dplyr
和plyr
冲突如下对象:arrange, count, desc, failwith, id, mutate, rename, summarise, summarize