并行处理-如何并行化嵌套循环的csh脚本

Question

我有四个不同的实验因素。

对于每个实验，我需要改变三个参数并调用fortran程序。我使用EOF构造将参数传递给fortran程序。

下面是一个示例代码:

set expfac=(0.1 0.3 0.5 0.7)
set fact1=(1 3 2 8)
set fact2=(9 2 1 4)
set fact3=(5 6 1 4)
@ exp = 1
while ( $exp <= $#expfac )
 foreach i ($fact1)
   foreach k ($fact2)
    foreach h ($fact3)
 ./PROGRAM << EOF
expfac     |$expfac[$exp]
fact1      |${i}
fact2      |${k}
fact3      |${h}
EOF
   end
  end
 end
@ exp += 1
end

如何并行处理while循环?也许使用GNU并行?

Answer 1

我的csh技能是垃圾，所以这里是bash:

parallel --header : './PROGRAM << EOF
expfac     |{expfac}
fact1      |{fact1}
fact2      |{fact2}
fact3      |{fact3}
EOF' ::: expfac 0.1 0.3 0.5 0.7 ::: fact1 1 3 2 8 ::: fact2 9 2 1 4 ::: fact3 5 6 1 4

不幸的是，如果值包含需要shell引用的字符("&'*"等)，则上述操作将失败。从你的例子来看，这对你来说似乎不是问题。