R软件包randomForest报告林中每个树的均方误差。然而，我需要对数据中的每个案例的置信度进行衡量。由于randomForest通过对单个树的预测进行平均来计算个案预测，我想也应该可以计算个案标准误差，从而计算置信区间。这可以使用输出randomForest对象来完成吗（如果是：如何？）或者我必须深入研究源代码吗？
无需深入研究源代码。您只需要阅读文档即可。?predict.randomForest声明其一个自变量称为predict.all:
predict.all是否应保留所有树的预测？
因此，将其设置为TRUE将为每种情况、每棵树保留一个预测，然后您可以使用它来计算每种情况的标准误差。
我最近了解到Stefan Wager、Trevor Hastie和Brad Efron的这篇论文，他们更严格地研究了随机森林（和其他袋装预测因子）产生的预测的标准误差概念。