如何在Cray XC上编译VASP 5.3.5

Question

我需要在Cray XC MPP机器上编译VASP 5.3.5。该系统提供Gnu、Intel和Cray编译环境。BLAS、LAPACK、ScaLAPCK也可以选择"英特尔MKL"或Cray LibSci。

哪一个是最好的编译器，最好的数值库和Makefile选项？

Answer 1

对ARCHER的测试(http://www.archer.ac.uk)已经表明，在Cray XC30系统上，将"英特尔编译器"与"英特尔MKL"one_answers"FFTW"结合使用，可以产生VASP 5.3.5的最佳性能和最稳定的内部版本。

完整的编译说明可在以下网址找到：

http://www.archer.ac.uk/documentation/software/vasp/compiling_5-3-5-phase2.php

简而言之，程序是：

module swap PrgEnv-cray PrgEnv-intel
module load fftw
module load cray-pe-hugepages2M

修改库makefile以具有以下选项：

CPP     = gcc -E -P -C $*.F >$*.f
FC=ftn 
CFLAGS = -O3
FFLAGS = -O3 -unroll -ip -no-prec-div -xAVX
FREE   = -free

构建库（假设makefile被称为"makefile.cray_xc_intel.lib"）：

cd vasp.5.lib
make -f makefile.cray_xc_intel.lib

移动到主源代码目录：

cd ../vasp.5.3

在Makefile中设置预处理器选项（这适用于多个K点版本）：

CPP    = $(CPP_) -DMPI -DHOST="CrayXC-Intel" 
         -DNGZhalf 
         -DLONGCHAR 
         -Dkind8 
         -DCACHE_SIZE=2000 
         -Davoidalloc 
         -DRPROMU_DGEMV  
         -DMPI_BLOCK=100000 
         -Duse_collective 
         -Drandom_array 
         -DscaLAPACK

设置makefile编译选项：

FC=ftn
FCL=$(FC)
CPP_ = ./preprocess <$*.F | cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)
FFLAGS = -free -march=corei7-avx -assume byterecl  -m64
OFLAG  = -O3 -ip -fno-alias -unroll-aggressive -opt-prefetch -use-intel-optimized-headers -no-prec-div
OFLAG_LOW = -O1 -g -ftz
OBJ_LOW = broydon.o

为"英特尔MKL:"设置makefile线性代数库选项

MKL_PATH = $(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS=
LAPACK=
BLACS=
SCA=
LIB  = ../vasp.5.lib/linpack_double.o -L../vasp.5.lib -ldmy 
        ${MKL_PATH}/libmkl_blas95_lp64.a ${MKL_PATH}/libmkl_lapack95_lp64.a 
        ${MKL_PATH}/libmkl_scalapack_lp64.a  
        -Wl,--start-group ${MKL_PATH}/libmkl_intel_lp64.a 
        ${MKL_PATH}/libmkl_sequential.a ${MKL_PATH}/libmkl_core.a 
        ${MKL_PATH}/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a  -Wl,--end-group -lpthread -lm

最后，设置链接FFTW:的makefile选项

FFT3D   = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o

现在构建代码（假设makefile被称为"makefile.cray_xc_intel"）：

make -f makefile.cray_xc_intel