目前我手动进行所有更新，这意味着当我对代码进行更改时，我会手动将更改的文件ftp到服务器。显然，我在玩火，所以我想开始使用一个更结构化的过程来发布我的php项目的更新。我使用带有Eclipse的Windows7作为我的IDE。我有一个linux开发框，你建议我使用哪个版本控制程序与Eclipse交互，从我的开发框中签出一个副本？进行更改并将这些更改提交回开发人员，测试代码并能够将更改提交到生产框中？（我假设这是正确的过程？）
Subversion或Git是不错的选择。它们都有集成到eclipse中的插件，可以满足您的需要。
他们确实使用了一些不同的范式，所以选择你最熟悉的范式。
我会使用类似git或mercurial的DVCS和分支。我使用了这里描述的分支模型的一个细微变化：
http://nvie.com/posts/a-successful-git-branching-model/
让我向您描述一下我的部署工作流程：
我有4个环境：
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prod：生产-即：现场 -
stage：暂存服务器，也称为测试环境。这是代码升级为产品之前的最后一站。 -
int：集成服务器 -
dev：开发
每个开发人员都有自己的本地代码副本，并使用前面描述的分支模型。
集成环境不断地合并开发人员推出的东西（我使用一个简单的提交挂钩和一个shell脚本来完成这一任务。你也可以考虑使用更复杂的CI工具来完成这项工作）。Int将拥有最新的"出血边缘"/"最新和最伟大"的应用程序版本。单元测试是用来确保没有人破坏任何东西。
就在发布之前，代码库被转移到阶段。像功能测试和UA测试这样的东西就在这一点上完成了。如果一切看起来都很好，那么我从一个阶段推到另一个阶段，代码就活了。
我个人使用NetBeans作为我的IDE——有一些插件可以很好地集成到git/mercial。
最后：开发工作流程/部署策略是您的项目/组织所独有的。我刚刚（大致）描述了我的观点——所有的观点可能适用于你，也可能不适用于你——但我希望你现在对理想情况下的工作方式有了一个想法。