r-compileCode中的Rcpp内联包错误



我已经安装了R以及这两个包Rcpp和inline。(我正在做一个项目,其中包括在R中加速一个非常慢的程序,我决定使用Rcpp)。。。我知道我做错了什么。。。可能少了一步,但我想不通。如果你在读这篇文章,就给德克道具!感谢Rcpp和全新的内联包pdf,但。。。它仍然没有运行。请注意,我是个新手。如前所述,我清理了所有其他包,只有R与Rcpp和内联一起安装(当然我也安装了c++)。

    library(Rcpp)
    library(inline)
    x<-as.numeric(1:10)
    n<-as.integer(10)
    code<-"
    integer i 
    do 1 i=1, n(1)
    1 x(i)=x(i)**3
    "
    cubefn<-                       cfunction(signature(n="integer",x="numeric"),code,convention=".Fortran")
     ERROR(s) during compilation: source code errors or   compiler      configuration errors!
                Program source:
      1: #include <R.h>
      2: 
      3: 
      4: extern "C" {
      5:   void filef2424e34d61 ( int * n, double * x );
      6: }
      7: 
      8: void filef2424e34d61 ( int * n, double * x ) {
      9: 
     10: integer i
     11: do 1 i=1, n(1)
     12: 1 x(i)=x(i)**3
     13: 
     14: }
    Error in compileCode(f, code, language, verbose) : 
      Compilation ERROR, function(s)/method(s) not created! 
    In addition: Warning message:
    running command 'C:/R/R-2.15.2/bin/x64/R CMD SHLIB filef2424e34d61.cpp 2> filef2424e34d61.cpp.err.txt' had status 1 

如果是缺少包骨架的构造:我尝试了简单的rcpp_hello_world()示例:

    rcpp_hello_world <- function(){
    .Call( "rcpp_hello_world", PACKAGE = "mypackage" )
    }
    Folder PATH listing for volume OS
    Volume serial number is 769C-A616
    C:.

剩下的是一长串奇怪的符号,但我能读到的是我所拥有的c++项目的名称,我没有包括它们,因为这太长了

    rcpp_hello_world <-function(){
    .Call("rcpp_hello_world",PACKAGE="mypackage")
    }
    rcpp_hello_world()
    Error in .Call("rcpp_hello_world", PACKAGE = "mypackage") : 
      "rcpp_hello_world" not available for .Call() for package "mypackage"

任何事情都会有帮助,我也安装了linux,所以如果这是一个更好的选择,请告诉我。我现在对任何事情都持开放态度,取得的最微小进展都是令人高兴的

您真的安装了Fortran编译器吗?

如果你没有,或者你不知道,试试你的Linux盒子。如果您想使用Rcpp和内联进行构建,则Windows上的R必须能够编译源程序包。一个好的快速测试是尝试类似的东西

R> myroot <- cppFunction('double myroot(double x) { return ::sqrt(x); }')
R> myroot(16)
[1] 4
R> 

或者等效地通过内联(其中rcppcxxfunction(..., plugin="Rcpp")调用的包装器,您需要最新的内联包)

R> myroot2 <- rcpp(signature(xs="numeric"), 
+                  body='double x=as<double>(xs); return wrap(::sqrt(x));')
R> myroot2(16)
[1] 4
R> 

如果这不起作用,请阅读安装Rtools for Windows等的R基础知识。我们在Rcpp常见问题解答中也有一些额外的注意事项。

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