Matplotlib/ genfromext:从.csv中，根据时间，跳过缺失的数据点的多个绘图

Question

我已经能够导入和绘制多列数据对同一x轴(时间)与图例，从csv文件使用genfromtxt显示在这个链接:

Matplotlib:直接从。csv

导入和绘制多个时间序列的图例

如果csv文件中的所有单元格都包含数据，则上面的简单示例可以正常工作。然而，我的一些单元格有丢失的数据，和一些参数(列)只包括数据点每例如第二或第三次增量。

我想将所有参数绘制在与之前相同的时间轴上;如果一列中缺少一个或多个数据点，我希望绘图函数跳过该参数缺少的数据点，只在该参数可用的点之间绘制线。

此外，我试图找到一个通用的解决方案，它将自动绘制在上述风格直接从csv文件的任何数量的列，时间点，缺失的数据点等，当这些都不知道提前。

我已经尝试使用genfromtxt选项missing_values和filling_values，如下面的非工作示例所示;但是我想跳过缺失的数据点，而不是给它们赋值'0';在任何情况下，用这种方法，我似乎得到"ValueError:无法转换字符串为浮动"时，遇到丢失的数据点。

在同一图上根据时间绘制多个参数，同时处理偶尔或经常跳过的值，这对于科学界来说一定是一个相当常见的问题。

我将非常感谢任何关于使用genfromext的优雅解决方案的建议。

下面的非工作代码和演示数据。衷心感谢。

Demo data: 'Data.csv':
Time,Parameter_1,Parameter_2,Parameter_3
0,10,12,11
1,20,,
2,25,23,
3,30,,30
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
arr = np.genfromtxt('DemoData.csv', delimiter=',', dtype=None, missing_values='', filling_values = 0)
names = (arr[0])
for n in range (1,len(names)):
    plt.plot (arr[1:,0],arr[1:,n],label=names[n])
plt.legend()    
plt.show()

Answer 1

我认为如果你在genfromtxt命令中设置usemask =True，它会做你想要的。可能不希望filling_values设置

arr = np.genfromtxt('DemoData.csv', delimiter=',', dtype=None, missing_values='',  usemask=True)

你可以这样绘制:

for n in range (1,len(names)):
    plot(arr[1:,0][logical_not(arr[1:,n].mask)], arr[1:,n].compressed())