r-如何将数据从GrAD导出到.csv文件或从NetCDF导出到.csv

Question

我很难将数据从GrADS导出到.csv文件，尽管这应该很容易。有问题的文件来自APHRDITE项目，涉及亚洲的降雨。基本上，我可以使用将此文件读取到GrADS中

open d:/aphro/aphro.ctl

它告诉我：

Data file d:/aphro/APHRO_MA_025deg_V1101R2.%y4 is open as file 1
Lon set to 60.125 149.875
Lat set to -14.875 54.875
Lev set to 1 1
Time values set: 1961:1:1:0 1961:1:1:0
E set to  1 1

如果我执行：

q ctlinfo

它还告诉我有三个变量：

precip 1 0 daily precipitation analysis
rstn 1 0  ratio of 0.05 degree grids with station
flag 1 0 ratio of 0.05 degree grids with snow

好的，现在我只想在.csv文件(或.txt)中生成一个列表，其中包含以下信息：

Precipitation   Lon    Lat   Time(date)

这听起来很简单，但我就是做不到。一种方法是使用：

fprintf precip d:/output.csv %g 1

这给了我一个.csv文件，在一个长列中包含当天的全部数据(这正是我想要的)。我也可以在不同的文件中对lon和lat做同样的操作，并将它们组合在一起。问题是，这需要很长时间来处理输出文件——如果你不介意有很多列，速度会快得多，但这会让你很难管理。基本上，这种方法太慢了。

另一种方法是通过以下方式将数据导出为NetCDF文件：

Set sdfwrite -4d d:/output.nc
define var = precip
sdfwrite precip

然后，它非常快速地编写了一个名为output.nc的文件，其中包含了我需要的所有数据。使用R，我可以单独读取所有变量，例如

f <- open.ncdf("D:/aphro/test.nc")
A <- get.var.ncdf(nc=f,varid="time")
B <- get.var.ncdf(nc=f,varid="rain")
D <- get.var.ncdf(nc=f,varid="lon")
E <- get.var.ncdf(nc=f,varid="lat")

但我想要的是制作一个输出文件，其中每行告诉我时间、降雨量、lon和lat。我尝试了rbind，但它没有将正确的时间(日期)与正确的降雨量相关联，并且类似地混淆了lon和lat，因为有几十万个降雨数据，但只有几个日期，只有360个lon点和280个lat点(即，降雨数据是几天内每天的数据网格)。我相信这应该很容易，但怎么做呢？

请帮助

Tony

Answer 1

据我所知，您可以通过同时使用气候数据运算符和R将GrAD文件更改为NetCDF文件。详细信息可以在这里找到。此外，可以将NetCDF文件转换为.csv文件。为此，我提供了一个伪代码。

library(ncdf)
nc <- open.ncdf("foo.nc")             #open ncdf file and read variables
lon <- get.var.ncdf(nc, "lon")         # Lon lat and Time
lat <- get.var.ncdf(nc, "lat")
time <- get.var.ncdf(nc, "time")
dname <- "t"                         # name of variable which can be found by using print(nc)
nlon <- dim(lon)
nlat<- dim(lat)
nt<- dim(time)
lonlat <- expand.grid(lon, lat)    # make grid of given longitude and latitude 
mintemp.array <- get.var.ncdf(nc, dname)
dlname <- att.get.ncdf(nc, dname, "long_name")
dunits <- att.get.ncdf(nc, dname, "units")
fillvalue <- att.get.ncdf(nc, dname, "_FillValue")
mintemp.vec.long <- as.vector(mintemp.array)
mintemp.mat <- matrix(mintemp.vec.long, nrow = nlon * nlat, ncol = nt)
mintemp.df <- data.frame(cbind(lonlat, mintemp.mat))
options(width = 110)
write.csv(mintemp.df, "mintemp_my.csv")

我希望它能解释你的问题。