Snakemake-Tibanna配置支持



我试图运行snakemake --tibanna,使用Tibanna创建的"Unicorn"步骤函数在AWS上部署Snakemake。

我似乎找不到改变Tibanna接受的不同参数的方法,比如哪个子网、AZ或安全组将用于实际部署的EC2实例。

参数示例(在没有Snakemake的情况下运行Tibanna时(:https://github.com/4dn-dcic/tibanna/blob/master/test_json/unicorn/shelltest4.json#L32

谢谢!

您注意到这个选项了吗?

蛇制造——帮助

--tibanna-config tibanna_config[tibanna_config…]附加的tibanan配置,例如--tibanna-configspot_instance=真子网=安全性组=

我想它是最近添加的。

-jk

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