在 OpenMP 中使用共享数据结构而不是私有数据结构时的性能差异

Question

我一直在研究 OpenMP，并试图弄清楚为什么在将数组保持为共享而不是私有时性能会下降。任何输入都会有所帮助。

当阵列被共享时，运行大约需要 65 毫秒，而如果它是私有的，那么在英特尔至强 E5540 CPU 上大约需要 38 毫秒。以下代码是在 Ubuntu 上使用 GCC 4.4.3 编译

的

我不认为这是由于错误共享，因为只对数组元素执行读取操作。

#define PI 3.14159265
#define large 1000000
double e[large];
int main() {
    int i,j,k,m;
    timeval t1,t2;
    double elapsedtime;
    omp_set_num_threads(16);
    for(i=0;i<large;i++) {
        e[i]=rand();
    }
    gettimeofday(&t1, NULL);
    #pragma omp parallel for private(i) shared(e)   
//  #pragma omp parallel for private(i,e)

    for(i=0;i<large;i++) {
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
    }
    gettimeofday(&t2, NULL);
    elapsedtime = (t2.tv_sec*1000000 + t2.tv_usec) - (t1.tv_sec * 1000000 + t1.tv_usec);
    printf("%f ",elapsedtime/1000);
    return 0;
}

Answer 1

我决定摆脱全局变量。那是你的代码，在几个地方修改了。

//timings.cpp
#include <sys/time.h>
#include <cstdlib>
#include <stdio.h>
#include <math.h>
#include <omp.h>
#include <unistd.h>
#define PI 3.14159265
#define large 100000
int main() {
    int i;
    timeval t1,t2;
    double elapsedtime;
    bool b=false;
    double e[large];
    double p[large];
    omp_set_num_threads(1);
    for(i=0;i<large;i++) {
        e[i]=9.0;
    }
   /* for(i=0;i<large;i++) {
       p[i]=9.0;
    }*/
     gettimeofday(&t1, NULL);
  #pragma omp parallel for firstprivate(b) private(i) shared(e)
  //#pragma omp parallel for firstprivate(b) private(e,i)
     for(i=0;i<large;i++) {
        if (!b)
        {
            printf("e[i]=%f, e address: %p, n=%dn",e[i],&e,omp_get_thread_num());
            b=true;
        }
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
        fmodf((exp(log((sin(e[i]*PI/180)+cos((e[i]*2)*PI/180))*10))*PI),3.0);
    }
    gettimeofday(&t2, NULL);
    elapsedtime = (t2.tv_sec*1000000 + t2.tv_usec) - (t1.tv_sec * 1000000 + t1.tv_usec);
    printf("%f ",elapsedtime/1000);
    return 0;
}

我们将通过脚本"1.sh"运行它以自动测量时间，

#/bin/bash
sed -i '/parallel/ s,#,//#,g' timings.cpp
sed -i '/parallel/ s,////#,#,g' timings.cpp
g++ -O0 -fopenmp timings.cpp -o timings
> time1.txt
for loopvar in {1..10}
do
if [ "$loopvar" -eq 1 ]
then
./timings >> time1.txt;
cat time1.txt;
echo;
else
./timings | tail -1 >> time1.txt;
fi
done
echo "---------"
echo "Total time:"
echo `tail -1 time1.txt | sed s/' '/'+'/g | sed s/$/0/ | bc -li | tail -1`/`tail -1 time1.txt| wc -w | sed s/$/.0/` | bc -li | tail -1

以下是测试结果(Intel@酷睿2双核E8300(：

1( #pragma OMP 并行 对于 Firstprivate(B( private(i( shared(e(

user@comp:~ ./1.sh
Total time:
152.96380000000000000000

我们有奇怪的延迟。例如输出：

e[i]=9.000000, e address: 0x7fffb67c6960, n=0
e[i]=9.000000, e address: 0x7fffb67c6960, n=7
e[i]=9.000000, e address: 0x7fffb67c6960, n=8
//etc..

注意地址 - 所有数组都是一样的(所以它被称为共享(

2( #pragma OMP 并行 for Firstprivate(e，b( private(i(

user@comp:~ ./1.sh
Total time:
157.48220000000000000000

我们将数据 e(firstprivate(复制到每个线程例如输出：

e[i]=9.000000, e address: 0x7ff93c4238e0, n=1
e[i]=9.000000, e address: 0x7ff939c1e8e0, n=6
e[i]=9.000000, e address: 0x7ff93ac208e0, n=4

3( #pragma OMP 并行 for Firstprivate(b( private(e，i(

Total time:
123.97110000000000000000

不复制数据，只分配(私有未初始化(例如输出：

 e[i]=0.000000, e address: 0x7fca98bdb8e0, n=1
 e[i]=0.000000, e address: 0x7fffa2d10090, n=0
 e[i]=0.000000, e address: 0x7fca983da8e0, n=2

这里我们有不同的地址，但所有 e 值都包含内存垃圾(nills 可能是由于 mmap 内存页预分配造成的(。

要看到，firstprivate(e( 由于数组的复制而变慢，让我们注释掉所有计算(带有"fmodf"的行(#pragma 第一私有(B(私有(i(共享(e(的OMP并行

Total time:
9.69700000000000000000

#pragma OMP 并行 for firstprivate(e，b( private(i(

Total time:
12.83000000000000000000

#pragma omp parallel for firstprivate(b( private(i，e(

Total time:
9.34880000000000000000

Firstprivate(e( 由于复制数组而变慢。由于计算线的原因，共享(e( 很慢。

使用 -O3 编译 -ftree-vectorize 略微减少了共享时间：

#pragma OMP 并行 for firstprivate(b( private(i( shared(e(

user@comp:~ ./1.sh
Total time:
141.38330000000000000000

#pragma OMP parallel for firstprivate(b( private(e，i(

Total time:
121.80390000000000000000

使用时间表(静态，256(并不能解决问题。

让我们继续打开 -O0 选项。注释掉数组填充：//e[i]=9.0;

#pragma OMP 并行 for firstprivate(b( private(i( shared(e(

Total time:
121.40780000000000000000

#pragma OMP parallel for firstprivate(b( private(e，i(

Total time:
122.33990000000000000000

因此，">

共享"速度较慢，因为"私有"数据未初始化使用(如评论者所建议的那样(。

让我们看看对线程数的依赖性：

4threads
shared
Total time:
156.95030000000000000000
private
Total time:
121.11390000000000000000
2threads
shared
Total time:
155.96970000000000000000
private
Total time:
126.62130000000000000000
1thread (perfomance goes down ca. twice, I have 2-core machine)
shared
Total time:
283.06280000000000000000
private
Total time:
229.37680000000000000000

为了用 1.sh 编译它，我手动取消了两个"并行"行，以 1.sh 注释它们。

**1thread without parallel, initialized e[i]**
Total time:
281.22040000000000000000
**1thread without parallel, uninitialized e[i]** 
Total time:
231.66060000000000000000

因此，这不是 OpenMP 问题，而是内存/缓存使用问题。生成 asm 代码

g++ -O0 -S timings.cpp

在这两种情况下，都会给出两个区别：一个，在标签 LC 编号中可以忽略，另一个，一个标签 (L3( 在初始化 E 数组时包含的不是 1 行，而是 5 个 ASM 行：

L3:
movl    -800060(%rbp), %eax
movslq  %eax, %rdx
movabsq $4621256167635550208, %rax
movq    %rax, -800016(%rbp,%rdx,8)

(初始化发生的地方(和公共行： addl $1, -800060(%rbp)

所以，这似乎是缓存问题。

这不是答案，你可以使用上面的代码进一步研究问题，