我目前正在尝试将网络对象转换为igraph对象。从各种帖子中,我了解到intergraph
包可以通过asIgraph()
功能做到这一点。我正在尝试转换经典的桑普森数据集,该数据集可在ergm
包中找到。当我这样做时:
> library(ergm)
> library(intergraph)
> library(igraph)
> data(sampson)
> class(samplike) # The network object
[1] "network"
> asIgraph(samplike)
Error in (function (..., row.names = NULL, check.rows = FALSE, check.names = TRUE, :
arguments imply differing number of rows: 88, 26
我有上面的错误。有谁知道为什么这个规范数据集会失败?
编辑:查看两周前在
ergm
GitHub上的最新帖子 修复了桑普森的"提名"属性 数据。 这是桑普森数据集中的一个错误,现已修复 GitHub 版本,但尚未更新到 CRAN。
它失败了,因为sampson
数据集具有边属性nominations
即使数据集中有 88 条边,该属性也只有 26 个值。当intergraph
尝试转换为igraph
时,它会尝试使用asDF()
将边缘属性绑定到边缘列表,但此步骤失败。简单的事情是像这样删除边缘属性:
smplk<-samplike
delete.edge.attribute(smplk, "nominations")
asIgraph(smplk)
IGRAPH dca72f1 D--- 18 88 --
+ attr: cloisterville (v/l), group (v/c), na (v/l), vertex.names
| (v/c), na (e/l)
...
从文档中我有点不清楚此属性应该如何映射到边缘列表,但如果可以确定这一点,则可以将其与set.edge.attribute
单独添加。