我有一个运行很长时间的程序，大约3周。它实际上是一个模拟应用程序。
在那之后，通常内存被填满，系统变得没有响应，我不得不重新启动整个计算机。我真的不想这样做，因为我们正在谈论Ubuntu Linux 14.04 LTS，我认为有一种方法可以避免这种情况。Swap是关闭的，因为让程序的东西交换会使它变慢太多。
该程序部分使用c++(约10%)和FORTRAN(约90%)编写，并使用GNU编译器套件(g++和gfortran)进行编译和链接。
回到我的问题:
有没有一种好的方法来保护系统不受那些程序的干扰，而不是虚拟机?
注:我知道这个程序有bug，但我现在无法修复，所以我想保护系统不被挂起。我也不能使用调试器，因为它会运行太长时间。
编辑:在一些评论之后，我想澄清一些事情。代码太复杂了。我没有时间去修复bug，而且有些版本我甚至连源代码都没有。我必须运行它，因为我们被迫这样做。你并不总是有选择的余地。不运行这样的程序不是一个选项，因为它仍然会产生一些结果。所以重新启动系统是一个变通办法，但我想做得更好。我认为无限制是一种选择，没有考虑过那个。也许会有帮助。
限制这个蹩脚的应用程序内存是最简单的部分。例如，您可以使用Docker (https://goldmann.pl/blog/2014/09/11/resource-management-in-docker/#_memory)或cgroup，它们是一种虚拟机，但开销要小得多。如评论中所述，ulimit也可能是一种选择。
这里真正的问题是要意识到，如果您的模拟程序在内存耗尽时被终止，您实际上可以使用生成的结果吗?这个程序是否做了一些检查点来从崩溃中恢复?
同样，带有内存泄漏的编写糟糕的程序也经常出现更严重的问题，比如溢出，如果你做真正的科学研究，这会使结果完全无用。
您可以尝试使用valgrind来调试内存问题。Fortran也有很好的编译指令用于数组边界检查，如果可以的话，您应该激活这些设置。