Snakemake:在递归子工作流方案中引用父级以外的输出

Question

我有一个包含三层子工作流的工作流，其中 wfA 是 wfB 的子工作流是 wfC 的子工作流。

执行 wfC 时，如果需要，wfA 和 wfB 都会正确执行。

在 wfC 中，我可以做 wfB("some/output"(，但我不能做 wfA("some/output"(，因为它会给出"名称'wfA'未定义"错误。

这是受支持的吗？还有其他方法吗？

Answer 1

目前，这不受支持，除了扁平化层次结构之外，我认为没有办法。