尝试使用RPY2模块从Python脚本调用R-帮助设置R主目录

Question

我的目标是能够从Python 2.7脚本调用R。我首先使用Easy_install获取RPY2模块。然后，我将以下命令键入我的间谍控制台：

from rpy2.robjects.packages import importr

这引起了以下错误：

" RuntimeError：无法确定R主目录。

尝试安装r https://www.r-project.org/，将R_HOME环境变量设置为R HOME目录，或将R解释器的目录添加到路径环境变量。"

。"

看起来RPY2中的R解释器没有找到R，因为它不在正确的目录中？我以前曾将R和Rstudio下载到我的Mac上。

我怀疑这是一个简单的修复程序，我希望有人可以解释此错误消息的含义，以及我应该如何更新R_HOME或PATH环境变量（我不确定这些是什么是什么）。/p>

Answer 1

rpy2正在您的PATH中寻找可执行的R。这意味着，打开终端窗口并输入R时，R终端应启动。由于您看到了该错误消息，因此找不到任何R。

查找R在哪里，并将该目录附加到您的路径上（例如，export PATH=/where/R/is:${PATH}-如果通过单击应用程序图标启动Spyder，则可以将其放在您的~/.bashrc上）。