当鼠标返回错误时，在 R 中插补"system is computationally singular"

Question

>我正在尝试对中等大小的数据帧(~100,000 行(进行插补，其中 5 列中有 30 列具有 NA(比例很大，约为 60%(。

我使用以下代码尝试了鼠标：

library(mice)    
data_3 = complete(mice(data_2))

第一次迭代后，我得到了以下异常：

iter imp variable
  1   1  Existing_EMI  Loan_Amount  Loan_Period
Error in solve.default(xtx + diag(pen)): system is computationally singular: reciprocal condition number = 1.08007e-16

是否有其他软件包对这种情况更强大？ 我该如何处理这个问题？

Answer 1

您的 5 列可能有许多不平衡因素。当这些变量变成虚拟变量时，您很有可能将一列作为另一列的线性组合。mice的默认插补方法涉及线性回归，这会导致 X 矩阵无法反转，并将导致您的错误。

将正在使用的方法更改为其他内容，例如购物车 - mice(data_2, method = "cart") --.还要检查您在插补之前/期间调用的种子，以获得可重现的结果。

我的建议是浏览老鼠的7个小插曲。您可以了解如何更改用于单独列而不是整个数据集的插补method。