featureCounts在Windows 10计算机上的Linux子系统中的minconda下调用。
featureCounts -a /mnt/d/.../__.txt -F SAF -readExtensions3 200 -o ___.tsv -O file1.bam file2.bam file3p.bam file4.bam file5.bam file6.bam file7.bam file8.bam
这始终会导致错误消息
featureCounts: invalid option -- 'r'
Version 2.0.1
Usage: featureCounts [options] -a <annotation_file> -o <output_file> input_file1 [input_file2] ...
## Mandatory arguments:
-a <string> Name of an annotation file. GTF/GFF format by default. See...
然后重新打印 featureCounts 函数的必需参数和可选参数。
有谁知道错误消息"无效选项 --'r'"是什么意思？我该如何解决它？
在命令提示符下调用 featureCounts(或 Mac 上的终端(和在 Linux/miniconda3 中调用它有什么区别吗？
似乎您输入了选项名称，它应该--readExtension3前面有两个破折号，最后没有"s"。我在--fraction上遇到了类似的问题，这导致我来到这里！