无法安装 scikits.sparse - Clang 错误

Question

我在使用django时遇到了以下错误：

Exception Type: ImportError
Exception Value:    No module named sparse

导入错误来自：

from sklearn.svm.sparse import LinearSVC
from nltk.classify.scikitlearn import SklearnClassifier

为了解决这个问题，我正在尝试通过以下方式安装 scikit-learn 的稀疏模块：

sudo easy_install scikits.sparse

但是我收到此错误：

no previously-included directories found matching 'doc/_build'
warning: no previously-included files matching '*~' found anywhere in distribution
warning: no previously-included files matching '*.so' found anywhere in distribution
warning: no previously-included files matching '*.pyc' found anywhere in distribution
clang: error: no such file or directory: 'scikits/sparse/cholmod.c'
clang: error: no input files
error: Setup script exited with error: command 'clang' failed with exit status 1

如何解决这个问题？

谢谢。

Answer 1

更改

from sklearn.svm.sparse import LinearSVC

自

from sklearn.svm import LinearSVC

忘记scikits.sparse，这与scikit-learn无关。sklearn.svm.sparse模块在几个版本前从scikit-learn中删除。

Answer 2

对于任何

对安装 scikits.sparse 特别感兴趣的人。我在Mac OS X 10.9中遇到了问题。问题与设置工具根据您是否安装了Cython和Pyrex做出假设有关。

一个解决方案，当然不是最好的解决方案（对我有用）是安装 Pyrex。对于 macports 用户：

sudo port install py27-pyrex

安装 SparseSuite。

编辑 setup.py 文件，以便ext_modules的值如下：

ext_modules = [
    Extension("scikits.sparse.cholmod",
              ["scikits/sparse/cholmod.pyx"],
              libraries=["cholmod"],
              include_dirs=[np.get_include(), "path/to/sparsesuite/include"],
              library_dirs=["path/to/sparsesuite/lib"]
              ),
    ]

对我来说，SparseSuite 的包含和库目录是 usr/local/include 和/usr/local/lib。

在scikits/sparse/cholmod.pyx文件中编辑以下行：

cdef extern from "sparsesuite/cholmod.h":

自

cdef extern from "cholmod.h":

然后尝试再次安装 scikits.sparse。应该工作。