如何在python中组合随机数量的列表

Question

我正在编写一个程序，该程序通过FASTQ文件进行读取，并给出该文件中每个序列的N值。我设法得到了每行N的数量，并把它们放在了一个列表中。问题是，我需要一个列表中的所有数字与文件中N的总数相加，但它们会打印在自己的列表中。

C:UsersZokidsDesktop>N_counting.py test.fastq
[4]
4
[3]
3
[5]
5 

这是我的输出，列表和列表中的总金额。我见过手动组合列表的方法，但一个列表可以有数百个序列，所以这是不可行的。

def Count_N(line):
    '''
    This function takes a line and counts the anmount of N´s in the line
    '''
    List = []
    Count = line.count("N") # Count the amount of N´s that are in the line returned by import_fastq_file
    List.append(int(Count))
    Total = sum(List)
    print(List)
    print(Total)

这就是我的代码，另一个函数选择行。

我希望有人能帮我。提前谢谢。

Answer 1

您在函数中定义的List永远不会得到多个项，因此它不是很有用。相反，您可能应该将函数的计数return，并让调用代码（可能在某种循环中运行）将值append放到自己的列表中。当然，由于函数没有太多内容，您也可以将其内容移到循环中！

例如：

list_of_counts = []
for line in my_file:
    count = line.count("N")
    list_of_counts.append(count)
total = sum(list_of_counts)

Answer 2

从代码中可以看出，每次调用count_N（）都会发送一行。您声明的列表是一个本地列表，每次调用函数时都会重新初始化。您可以使用声明列表为全局

global List =[]

我认为您还需要在函数外部声明列表，以便全局访问它。

此外，如果您在函数之外合计列表，效果会更好。现在你们正在对函数内部的列表进行总结。为此，您需要将缩进与函数声明相匹配。