图中的并行计算



我想对图做一些分析,以找到图中所有节点对之间所有可能的简单路径。在Networkx库的帮助下,我可以使用DFS通过此功能查找2个节点之间的所有可能路径:

nx.all_simple_paths(G,source,target)

下面的代码在没有任何工作负载的情况下运行,因为我的玩具示例在图形中只包含 6 个节点。但是,在我的实际任务中,我的图包含 5,213 个节点和 11,377,786 条边,使用以下解决方案无法在此图中找到所有可能的简单路径:

import networkx as nx
graph = nx.DiGraph()
graph.add_weighted_edges_from(final_edges_list) 
list_of_nodes = list(graph.nodes())
paths = {}
for n1 in list_of_nodes:
for n2 in list_of_nodes:
if n1 != n2:
all_simple_paths = list(nx.all_simple_paths(graph,n1,n2))
paths[n1+ "-"+n2] = all_simple_paths
">

paths"字典将"n1-n2"(分别为源节点和目标节点(作为键,并将所有简单路径的列表作为值。

问题是我是否可以在这种情况下使用多处理,以便在我的原始问题上运行此代码。我对处理器、线程、共享内存和 CPU 内核的了解非常幼稚,我不确定我是否真的可以在我的任务中使用并发(并行运行我的嵌套循环(。 我使用具有128 GB RAM和32核CPU的Windows服务器。

PS:彻底搜索网络(主要是StackOverFlow(,我找到了建议使用线程的解决方案,而其他人则建议使用多处理。我不确定我是否理解这两者之间的区别:|

如果要使用线程,请使用线程池执行器将函数调用提交到线程。它将返回一个未来的对象。Future.result(( 将返回调用返回的值。如果调用尚未完成,则此方法将等待超时秒数。如果调用直到那时仍未完成,它将引发超时错误。

with ThreadPoolExecutor() as executor:
for n1 in list_of_nodes:
for n2 in list_of_nodes:
if n1 != n2:
all_simple_paths_futures = executor.submit(nx.all_simple_paths, graph,n1,n2)
paths[n1+ "-"+n2] = all_simple_paths_futures
try:            
for key in paths.keys():
# get back  results from thread
future_obj = paths[key]
paths[key]= list(future_obj.result())
except Exception as e:
print(e)
raise e

有关多处理和线程之间的区别,请查看此链接:多处理与线程Python

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