Numpy 3d数组-沿给定轴选择最大元素



我有一个numpy数组,它的维度为(x, y, z) =(5,50,4)。对于每个(x, y)对,我想找到最大值沿z轴的索引。该指数在(4)范围内。我想选择所有这些"最大值"元素并将它们设置为1。然后,我要选择所有其他元素并将它们设置为0。

用另一种方式来解释,我想看看z方向上的所有向量(这些向量总共有x*y)。我想把最大元素设为1,其他元素设为0。例如,向量(0.25,0.1,0.5,0.15)将变成(0,0,1,0)。

我已经尝试了很多不同的东西。argmax函数似乎应该有所帮助。但是我如何使用它来正确地选择元素呢?我试过……
x = data
i = x.argmax(axis = 2)
x[i] # shape = (5, 50, 50, 4)
x[:,:,i] # shape = (5, 50, 5, 50)
x[np.unravel_index(i), x.shape] # shape = (5, 50)

最后一个,使用了np。的形状是正确的,但是所选的索引不是沿z轴的最大值。所以我遇到了一些麻烦。如果有人能帮忙,那就太棒了。谢谢!


编辑:这是我发现的一种方法。但如果有人有什么更快的,请告诉我!
def fix_vector(a):
    i = a.argmax()
    a = a*0
    a[i] = 1
    return a
y = np.apply_along_axis(fix_vector, axis=2, arr=x)

我真的想优化这个,如果可能的话,因为我调用这个函数很多次。


编辑:感谢帝斯曼提供了一个很好的解决方案。下面是一个小的示例数据集,根据评论的要求。
data = np.random.random((3,5,4))
desired_output = np.apply_along_axis(fix_vector, axis=2, arr=data)

这使用了我上面发布的fix_vector函数,但是DSM的解决方案更快。再次感谢!

这不是特别优雅,但是:

def faster(x):
    d = x.reshape(-1, x.shape[-1])
    d2 = np.zeros_like(d)
    d2[np.arange(len(d2)), d.argmax(1)] = 1
    d2 = d2.reshape(x.shape)
    return d2

似乎比fix_vector方法快一些。例如:

>>> x,y,z = 5,50,4
>>> data = np.random.random((x,y,z))
>>> np.allclose(orig(data), faster(data))
True
>>> %timeit -n 1000 orig(data)
1000 loops, best of 3: 5.77 ms per loop
>>> %timeit -n 1000 faster(data)
1000 loops, best of 3: 36.6 µs per loop

这可以用numpy.where

完成
import numpy as np
a = np.array([[[ 0.25,  0.10 ,  0.50 ,  0.15],
               [ 0.50,  0.60 ,  0.40 ,  0.30]],
              [[ 0.25,  0.50 ,  0.20 ,  0.70],
               [ 0.80,  0.10 ,  0.50 ,  0.15]]])

沿着最后一个轴找到最大值

b = a.max(-1)    #shape is (2,2)

b添加一个轴,以便它将广播到a并创建一个布尔数组。

condition = a == b[..., np.newaxis]

使用numpy.where进行替换。

c = np.where(condition, 1, 0)
>>> c
array([[[0, 0, 1, 0],
        [0, 1, 0, 0]],
       [[0, 0, 0, 1],
        [1, 0, 0, 0]]])

def f(a):
    b = a.max(-1)
    condition = a == b[..., np.newaxis]
    return np.where(condition, 1, 0)

所以我不满意-我见过reshape比添加新轴更快的情况,所以我玩了一下。似乎numpy.where本身有点慢。在赋值时使用布尔索引的性能与@DSM的性能几乎相同。

def h(a):
    b = a.max(-1)
    condition = a == b[..., np.newaxis]
    a[condition] = 1
    a[np.logical_not(condition)] = 0
    return a

x, (2,3,4)样例形状:

In [934]: x
Out[934]: 
array([[[ 5,  7,  4, 15],
        [ 9, 23, 14,  9],
        [17, 13,  2,  1]],
       [[ 2, 18,  3, 18],
        [10, 12, 23, 14],
        [17, 23, 19, 13]]])

最后一个轴的max值-足够清楚,一个(2,3)数组:

In [935]: x.max(2)
Out[935]: 
array([[15, 23, 17],
       [18, 23, 23]])

沿着该轴协调索引

In [936]: I=x.argmax(2)
In [937]: I
Out[937]: 
array([[3, 1, 0],
       [1, 2, 1]], dtype=int32)

用这些索引索引x的一种方法。此时,我正在手动构建0轴和1轴索引。它需要自动化

In [938]: x[np.arange(2)[:,None], np.arange(3)[None,:], I]
Out[938]: 
array([[15, 23, 17],
       [18, 23, 23]])

相同的索引可以用来设置另一个数组中的值:

In [939]: y=np.zeros_like(x)   
In [940]: y[np.arange(2)[:,None],np.arange(3)[None,:],I]=x.max(2)
In [941]: y
Out[941]: 
array([[[ 0,  0,  0, 15],
        [ 0, 23,  0,  0],
        [17,  0,  0,  0]],
       [[ 0, 18,  0,  0],
        [ 0,  0, 23,  0],
        [ 0, 23,  0,  0]]])
技巧是想出一种更精简的方式来生成索引元组:
(np.arange(2)[:,None], np.arange(3)[None,:], I)
(array([[0],
    [1]]), 
 array([[0, 1, 2]]), 
 array([[3, 1, 0],
    [1, 2, 1]], dtype=int32))

np.ix_有帮助,尽管连接两个元组有点难看:

J = np.ix_(range(x.shape[0]), range(x.shape[1])) + (I,)

对扁平数组的索引可以更快:

In [998]: J1 = np.ravel_multi_index(J, x.shape)
In [999]: J1
Out[999]: 
array([[ 3,  5,  8],
     [13, 18, 21]], dtype=int32)
In [1000]: x.flat[J1]
Out[1000]: 
array([[15, 23, 17],
   [18, 23, 23]])
In [1001]: y.flat[J1]=2
In [1002]: y
Out[1002]: 
array([[[0, 0, 0, 2],
        [0, 2, 0, 0],
        [2, 0, 0, 0]],
       [[0, 2, 0, 0],
        [0, 0, 2, 0],
        [0, 2, 0, 0]]])

但是我仍然需要构建J索引元组。

这类似于DSM的解决方案,但坚持3个维度。尺寸的平坦化消除了xi_结构的需要。


def max_index(x, n, fn=np.argmax):
    # return multidimensional indexing tuple
    # applying fn along axis n
    I = fn(x, axis=n)
    alist = list(np.ix_(*[range(i) for i in I.shape]))
    alist.insert(n, I)
    return tuple(alist)

是一个通用函数,用于生成类似J的索引元组

y = np.zeros_like(x)
I = max_index(x, 1, np.argmin)
y[I] = x[I]
I = max_index(x, 1, np.argmax)
y[I] = x[I]

x的最小值和最大值(沿轴1)插入到y中。速度是DSMfaster的一半。

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