安装Assimulo和日晷 - 错误

Question

我想使用Assimulo和Sundials来解决Python中的微分代数方程，因此我正在尝试将其安装在Ubuntu上。

对于日晷的安装，我按照安装说明进行操作，据我了解它运行良好。

% cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/lib/sundials-3.1.1/  ~/opt/sundials/sundials-3.1.1
% make
% make install

然后我尝试使用命令安装 Assimulo pip3 install Assimulo ，但我收到一条错误消息。我还尝试按照安装 - Assimulo 3.0 文档中的说明下载安装文件并使用以下命令进行安装。它会导致相同的错误消息。

sudo python3 setup.py install --sundials-home=/usr/local/lib/sundials-3.1.1

这是我收到的错误消息：

  target build/src.linux-x86_64-3.6/assimulo/thirdparty/hairer/dopri5module.c does not exist:
   Assuming dopri5module.c was generated with "build_src --inplace" command.
error: 'assimulo/thirdparty/hairer/dopri5module.c' missing

出了什么问题，我该如何解决？任何帮助将不胜感激！

Answer 1

在 pip 安装 numpy 和 cython 之后，通过 pip install assimulo 在 macos 上安装时，我遇到了同样的错误。对我来说，使用conda env可以解决问题：

• 创建 conda 环境：conda create -n your_name_goes_here
• conda activate your_name_goes_here
• conda install python=3.6（我注意到你也可以使用 3.7）
• conda install -c conda-forge assimulo

Answer 2

我也有同样的错误消息。正如另一个答案中所建议的，您可以从Conda获得一个编译包。但是如果你想自己从源代码编译，在我看来，PyPI 源代码压缩包不包含所有需要的文件。至少缺少一些*.pyf文件。所以，我改用了SVN存储库：

svn checkout https://svn.jmodelica.org/assimulo/tags/Assimulo-3.0/ assimulo

通过编译这个源代码树，我设法通过了您遇到的原始错误，但是我现在遇到了另一个我还不知道如何解决的构建错误：

ssimulo/solvers/sundials.c: In function '__pyx_f_8assimulo_7solvers_8sundials_5CVode_initialize_cvode':
assimulo/solvers/sundials.c:33274:31: error: too many arguments to function 'CVodeCreate'
     __pyx_v_self->cvode_mem = CVodeCreate(__pyx_t_3, __pyx_t_4);