通过std::shared_ptr使用Rcpp和RcppParallel的线程安全函数指针



我想在RcppPrallel工作线程中使用线程安全函数指针。但我对这个小小的例子已经有问题了。无论我是在包中使用它并在DESCRIPTION文件中添加SystemRequirements: C++11,还是在标准cpp文件中使用它,并添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]],我都会得到相同的错误:"shared_ptr"不是"std"的成员。有人能帮我吗?非常感谢。

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
using namespace std;

double f1 (double x, double y) {
return x * y;
}
double f2 (double x, double y) {
std::shared_ptr<int> p1;
std::cout << "p1: " << p1.use_count() << 'n';
return x + y;
}
typedef double (*funcPtr)(double x, double y);
std::shared_ptr<funcPtr> selectf(std::string abc) {
std::shared_ptr<funcPtr> fp = NULL;
if(abc == "a"){
fp = std::make_shared<funcPtr>(new funcPtr(&f1));
}else {
fp = std::make_shared<funcPtr>(new funcPtr(&f2));
}
return fp;
}

// [[Rcpp::export]]
double f0(double x, double y, std::string abc){
double ret;
df = selectf(abc);
ret = df(x, y);
return(ret);
}

/*** R
if(FALSE){
f0(10, 10, "a")
}
*/

系统信息:

> sessionInfo()
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=German_Germany.1252 
[2] LC_CTYPE=German_Germany.1252   
[3] LC_MONETARY=German_Germany.1252
[4] LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=German_Germany.1252    
attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets 
[6] methods   base     
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.5.0  R6_2.2.2        magrittr_1.5   
[4] tools_3.5.0     withr_2.1.2     roxygen2_6.0.1 
[7] yaml_2.1.19     memoise_1.1.0   Rcpp_0.12.18   
[10] xml2_1.2.0      stringi_1.2.2   stringr_1.3.1  
[13] digest_0.6.15   commonmark_1.5  devtools_1.13.5

std::shared_ptr在标头<memory>中声明。尝试:

#include <memory>

你可以在这里找到它的文档。

前面的答案已经告诉了您#include <memory>;在接下来的文章中,你声称基本的例子不起作用——对我来说是这样。

但首先需要澄清的是:所有对添加(编译(函数的调用的内存管理都必须通过R的内存管理来实现。这就是Rcpp所做的,也是Rcpp记录的。现在,对于多线程代码,我们在RcppParalllel中有RMatrixRVector,因为我们不能从多线程代码干扰R的内存管理(及其单线程模式(;有关详细信息,请参阅RcppParallel的优秀文档。

也就是说,如果你确定你想要shared_ptr在定义的范围内,你可以。这是一个基于你链接的例子的工作副本。

代码

#include <memory>
#include <Rcpp.h>
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
struct C { int* data; };
// [[Rcpp::export]]
bool foo() {
std::shared_ptr<int> p1;
std::shared_ptr<int> p2 (nullptr);
std::shared_ptr<int> p3 (new int);
std::shared_ptr<int> p4 (new int, std::default_delete<int>());
std::shared_ptr<int> p5 (new int, [](int* p){delete p;}, std::allocator<int>());
std::shared_ptr<int> p6 (p5);
std::shared_ptr<int> p7 (std::move(p6));
std::shared_ptr<int> p8 (std::unique_ptr<int>(new int));
std::shared_ptr<C> obj (new C);
std::shared_ptr<int> p9 (obj, obj->data);
Rcpp::Rcout << "use_count:n";
Rcpp::Rcout << "p1: " << p1.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p2: " << p2.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p3: " << p3.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p4: " << p4.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p5: " << p5.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p6: " << p6.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p7: " << p7.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p8: " << p8.use_count() << 'n';
Rcpp::Rcout << "p9: " << p9.use_count() << 'n';
return true;
}

使用

R> Rcpp::sourceCpp("/tmp/soExample.cpp")
R> foo()
use_count:
p1: 0
p2: 0
p3: 1
p4: 1
p5: 2
p6: 0
p7: 2
p8: 1
p9: 2
[1] TRUE
R> 

相关内容

  • 没有找到相关文章

最新更新