素食主义者中simper的摘要函数为我的数据提供了如下所示的输出：
summary(with(env, simper(species, env$Habitat)))
Contrast: Fringe_Mudflat
average sd ratio ava avb cumsum
Bairdiella ronchus 0.255035 0.142025 1.7957 48.3333 50.6667 0.4708
Diapterus rhombeus 0.054406 0.086815 0.6267 6.1667 1.8333 0.5712
Stellifer colonensis 0.048659 0.086382 0.5633 5.5000 3.5000 0.6611
Sphoeroides testudineus 0.038510 0.041463 0.9288 0.0000 5.3333 0.7322
Anchovia clupeoides 0.026492 0.026885 0.9854 1.5000 3.6667 0.7811
从我读到的内容来看，这些百分比(平均值和累积量(似乎显示了对组间差异的百分比贡献。然而，第一个物种显然在每个群体(ava和avb(中都有非常接近的手段，因此它看起来确实像是正在拾取这个物种，因为它在群体之间具有相似性而不是差异性。有谁知道这绝对是异样、相似还是混合？
为什么"平均值"与第一个"累积量"如此不同，哪一个应该在论文中呈现？
有没有办法同时显示差异性和相似性的百分比。我看到人们在论文中提出这一点，我认为他们从Primer那里得到它，但我想在R中做到这一点。
有谁知道这绝对是异样、相似还是混合？
"vegan：：simper(("被定义为原始论文中描述的每个物种对布雷-柯蒂斯距离的贡献比例。
为什么"平均值"与第一个"累积量"如此不同，哪一个应该在论文中呈现？
文档在这里不清楚。 cumsum以总距离的百分比给出，如原始论文中所述。
请注意，西珀
非常严重地混淆了组差异之间和组内差异的平均值
您的数据集可能就是这种情况。