如果我在不同的荧光通道中拍摄多个图像(在用某些抗体/maker染色细胞后)，我如何自动定量每个标记阳性的细胞比例?有人在Python中做过类似的事情吗?
我已经可以使用Fiji (ImageJ)对只包含一种染色类型的细胞进行计数，但是我不能让它对包含两种染色类型的合并图像进行选择性计数。由于Fiji与python的交互很好，我在考虑编写一个脚本，查看每个只包含一种染色类型的图像，然后获得各自图像的x-y坐标，并检查它们之间的匹配。我不确定这是否是个好主意，我想知道，如果有人做过类似的事情，或者有更有效的方法来完成任务?
谢谢你的帮助!
您可以使用cont = cv2。Findcontours找到几乎是圆形的细胞并计数len(续).
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