自己的焦点统计功能(焦点、"raster"包、R)给出不正确的输出

Question

我是R和编程的初学者。所以我认为比问题很简单，但我找不到答案或解决它。

我有光栅（100*100 个单元格）。我需要在移动窗口通过 2D DFT 获取谐波幅度的中值（例如，窗口大小 = 21）。我在栅格包中找到了焦点函数。对于这个函数，我可以编写自己的函数，该函数获取值（窗口中的栅格值）并返回整个窗口的单个值。

r <- raster(matrix(rnorm(10000), nrow = 100, ncol = 100)) # creation of raster
win <- 21 # setting the window size
spectr <- function(d) {
  return(median(abs(spec.fft(x = 1:win, y = 1:win, z = (d - mean(d)))$A)))
} # i think "d" - the matrix of raster values in the window border
focal(x = r, w = matrix(1, win, win), fun = spectr())

输出： spec.fft（x = 1：win， y = 1：win， z = （d - mean（d））） 中的误差： 缺少参数"d"，没有默认值

我假设来自窗口的数据在函数中自动传输。我的代码中有什么错误？谢谢！

更新。为了测试需要加载库"光谱"：

install.packages("spectral")
library(spectral)

Answer 1

首先，要使用您之前在 focal() 中定义的函数，您只需删除函数名称后面()括号即可。

其次，你的函数使用 spectral::spec.fft 这要求z参数是一个矩阵。但是，焦点转发了一个值向量，正如我们从?focal中了解到的那样：

函数 fun 应该接受多个数字，并返回一个数字。

因此，您必须自己生成所需的矩阵。

请参阅此示例（但是，请检查输出的有效性）：

spectr <- function(d) {
  return(median(abs(spec.fft(x = 1:win, y = 1:win, 
                             z = (matrix(d, ncol = win, nrow = win) - mean(d)))$A
                             # eventually you have to reorder or transpose the matrix 
                             # if its order has some impact on spec.fft
                    )))
} 

让我们在focal()中使用该函数

focal(x = r, w = matrix(1, win, win), fun = spectr)
# class       : RasterLayer 
# dimensions  : 100, 100, 10000  (nrow, ncol, ncell)
# resolution  : 0.01, 0.01  (x, y)
# extent      : 0, 1, 0, 1  (xmin, xmax, ymin, ymax)
# coord. ref. : NA 
# data source : in memory
# names       : layer 
# values      : 0.03341064, 0.04557778  (min, max)