我是R的新手,并且通常是编程。我目前正在努力进行数据转换的代码,希望有人可以花一点时间帮助我。
在可再现的例子下方:
# Data
a <- c(rnorm(12, 20))
b <- c(rnorm(12, 25))
f1 <- rep(c("X","Y","Z"), each=4) #family
f2 <- rep(x = c(0,1,50,100), 3) #reference and test levels
dt <- data.frame(f1=factor(f1), f2=factor(f2), a,b)
#library loading
library(tidyverse)
目标:使用参考值计算所有值(a
,b
)。计算应为: a/a_ref
a_ref = a
当f2=0
取决于家庭时(f1
可以是X,Y或Z)。
我尝试使用此代码来解决此问题:
test <- filter(dt, f2!=0) %>% group_by(f1) %>%
mutate("a/a_ref"=a/(filter(dt, f2==0) %>% group_by(f1) %>% distinct(a) %>% pull))
我得到:
测试结果
您可以看到a
由a_ref
划分。但是我的脚本似乎回收了参考值的使用(a_ref
),而不论家庭f1
。
您是否有任何建议,因此A
是根据家庭计算的(f1
)?
谢谢您的阅读!
编辑
我找到了一种"手动"
做的方法 filter(dt, f1=="X") %>% mutate("a/a_ref"=a/(filter(dt, f1=="X" & f2==0) %>% distinct(a) %>% pull()))
f1 f2 a b a/a_ref
1 X 0 21.77605 24.53115 1.0000000
2 X 1 20.17327 24.02512 0.9263973
3 X 50 19.81482 25.58103 0.9099366
4 X 100 19.90205 24.66322 0.9139422
问题是我必须更新每个变量和家庭的代码,因此不是一种干净的方法。
# use this to reproduce the same dataset and results
set.seed(5)
# Data
a <- c(rnorm(12, 20))
b <- c(rnorm(12, 25))
f1 <- rep(c("X","Y","Z"), each=4) #family
f2 <- rep(x = c(0,1,50,100), 3) #reference and test levels
dt <- data.frame(f1=factor(f1), f2=factor(f2), a,b)
#library loading
library(tidyverse)
dt %>%
group_by(f1) %>% # for each f1 value
mutate(a_ref = a[f2 == 0], # get the a_ref and add it in each row
"a/a_ref" = a/a_ref) %>% # divide a and a_ref
ungroup() %>% # forget the grouping
filter(f2 != 0) # remove rows where f2 == 0
# # A tibble: 9 x 6
# f1 f2 a b a_ref `a/a_ref`
# <fctr> <fctr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
# 1 X 1 21.38436 24.84247 19.15914 1.1161437
# 2 X 50 18.74451 23.92824 19.15914 0.9783583
# 3 X 100 20.07014 24.86101 19.15914 1.0475490
# 4 Y 1 19.39709 22.81603 21.71144 0.8934042
# 5 Y 50 19.52783 25.24082 21.71144 0.8994260
# 6 Y 100 19.36463 24.74064 21.71144 0.8919090
# 7 Z 1 20.13811 25.94187 19.71423 1.0215013
# 8 Z 50 21.22763 26.46796 19.71423 1.0767671
# 9 Z 100 19.19822 25.70676 19.71423 0.9738257
您可以使用以上的变量来执行此操作:
dt %>%
group_by(f1) %>%
mutate_at(vars(a:b), funs(./.[f2 == 0])) %>%
ungroup()
或通常使用vars(a:z)
使用a
和z
之间的所有变量,只要它们是数据集中的一个变量。
另一种解决方案可以使用mutate_if
,例如:
dt %>%
group_by(f1) %>%
mutate_if(is.numeric, funs(./.[f2 == 0])) %>%
ungroup()
将函数应用于您拥有的所有数字变量。变量f1
和f2
将是因子变量,因此它仅排除这些变量。