到目前为止我有这个错误;
Configuration error:
could not find the MySQL installation include and/or library
directories. Manually specify the location of the MySQL
libraries and the header files and re-run R CMD INSTALL.
INSTRUCTIONS:
1. Define and export the 2 shell variables PKG_CPPFLAGS and
PKG_LIBS to include the directory for header files (*.h)
and libraries, for example (using Bourne shell syntax):
export PKG_CPPFLAGS="-I<MySQL-include-dir>"
export PKG_LIBS="-L<MySQL-lib-dir> -lmysqlclient"
Re-run the R INSTALL command:
R CMD INSTALL RMySQL_<version>.tar.gz
2. Alternatively, you may pass the configure arguments
--with-mysql-dir=<base-dir> (distribution directory)
or
--with-mysql-inc=<base-inc> (where MySQL header files reside)
--with-mysql-lib=<base-lib> (where MySQL libraries reside)
in the call to R INSTALL --configure-args='...'
R CMD INSTALL --configure-args='--with-mysql-dir=DIR' RMySQL_<version>.tar.gz
ERROR: configuration failed for package ‘RMySQL’
* removing ‘/home/samuel/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RMySQL’
Warning in install.packages :
installation of package ‘./RMySQL_0.9-3.tar.gz’ had non-zero exit status
所以我遵循它在1处的内容
我输入export PKG_CPPFLAGS="-I</usr/include/mysql>"
export PKG_LIBS="-L</usr/lib/mysql> -lmysqlclient"
，然后再尝试在终端上安装他们给我的命令
R CMD INSTALL RMySQL_<version>.tar.gz
得到;
checking for unistd.h... yes
checking mysql.h usability... no
checking mysql.h presence... no
checking for mysql.h... no
configure: creating ./config.status
config.status: creating src/Makevars
** libs
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I</usr/include/mysql> -fpic -O3 -pipe -g -c RS-DBI.c -o RS-DBI.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I</usr/include/mysql> -fpic -O3 -pipe -g -c RS-MySQL.c -o RS-MySQL.o
In file included from RS-MySQL.c:22:0:
RS-MySQL.h:32:19: fatal error: mysql.h: No existe el archivo o el directorio
#include <mysql.h>
^
compilation terminated.
make: *** [RS-MySQL.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RMySQL’
所以查找我找到了这个建议;
安装mysql时出现错误RS-MySQL.h:32:19:致命错误:mysql.h: No such file
和后面的内容:
http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQLi don't get this step;
3。编辑或创建文件Renviron。并添加变量MYSQL_HOME，其中包含MySQL的安装位置。该文件通常不会在安装R时创建，因此您可能需要自己创建它。您需要将它放在R Home区域的/etc目录下。如果您不知道它在哪里，您可以在R提示符下执行R.home()。您将在variable=value语法中添加一个名为MYSQL_HOME的变量。这里有一个例子:Renviron的位置。网站:C:/PROGRA ~ 1/R/R - 2.11 ~ 1.0/etc/Renviron.site内容是:MYSQL_HOME = C:/PROGRA ~ 1/MySQL/MySQL ~ 1.0/
因为，当我在Renviron。网站，它不允许我编辑任何东西，我也不清楚我应该在那里写什么，不管怎样，我写了
MYSQL_HOME=C:/PROGRA~1/MySQL/MYSQLS~1.0/***
但是我不能保存它，它不允许，我不能在/etc/
对于我来说，我只需要得到包含这些文件的正确包
sudo apt-get install libmysqlclient-dev
对于我的ubuntu版本14.04.3，我所需要做的就是:
install.packages("RMySQL", dependencies=TRUE)
在windows机器上有更多的问题，但是，结果是perl的兼容性问题，所以我(1)卸载了perl，(2)以同样的方式安装了RMySQL，然后(3)重新安装了perl。
您的输入是错误的，首先去掉大于号和小于号。对于MySQL include目录，运行命令:
$ mysql_config --include
所以如果它是你已经提供的相同路径，而不是:
export PKG_CPPFLAGS="-I</usr/include/mysql>"
输入:
export PKG_CPPFLAGS="-I/usr/include/mysql"
为库路径输入命令:
$ mysql_config --libs
和上面一样，输入不带符号的路径，对我来说是这样的:
export PKG_LIBS="-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -lmysqlclient"
最后在最后一个输入中指定版本号，而不是"version"。这些步骤应该可以解决您的问题。对于编辑和写入/etc/目录，您应该有权限，如果您是管理员，您可以通过sudo命令执行该操作。而且你提供的路径是Windows的，不是linux的
这个很适合我:
sudo apt-get install r-cran-rmysql
当我尝试在R中安装RMySQL时，它提示一个错误说:
Configuration failed because no mysql client library was found. Try installing:
* deb: libmariadbclient-dev | libmariadb-client-lgpl-dev (Debian, Ubuntu)
然后我刚刚做了:
sudo apt-get install libmariadbclient-dev
sudo apt-get install libmariadb-client-lgpl-dev
和我能够安装RMySQL在R使用:
install.packages("RMySQL", dependencies=TRUE)
这是因为mysql.h (headers)文件在机器上丢失了
喂:1 尝试从机器
中找到mysql.h文件find / -name mysql.h
如果你找不到喂:2 尝试重新安装
sudo yum reinstall mysql-devel
Sudo yum reinstall mysql-client
如果是社区服务器
sudo yum reinstall mysql-community-devel
Sudo yum reinstall mysql-community-client
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