从 AllenSDK 运行“细胞类型”笔记本时出现类型错误

Question

>我正在运行单元格类型笔记本的第一行：

sweep_number = 30
sweep_data = data_set.get_sweep(sweep_number)

我收到此错误：

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TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-8-1ff88b13fc24> in <module>()
      4 
      5 sweep_number = 30
----> 6 sweep_data = data_set.get_sweep(sweep_number)
      7 
C:ProgramDataAnaconda3libsite-packagesallensdkcorenwb_data_set.py in get_sweep(self, sweep_number)
    112                 unit = stimulus_dataset.attrs["unit"]
    113                 unit_str = None
--> 114                 if unit.startswith('A'):
    115                     unit_str = "Amps"
    116                 elif unit.startswith('V'):
TypeError: startswith first arg must be bytes or a tuple of bytes, not str

Answer 1

您

看到的错误是由以下事实引起的：unit变量是字节文本，并且allensdk尝试使用其上的字符串调用endswith。这行不通，但这不是你的错。这是从 Python 2 迁移到 Python 3 时的常见错误(引入了字节类型;有关详细信息，请参阅此处(。我猜你正在运行Python 3，这会导致错误，因为allensdk在这里不能处理字节。

要解决此问题，您必须安装 Python 2，因为您使用的是 conda，请创建一个使用 Python 2 的环境。这可以按如下方式完成：

> conda create -n py2allen python=2.7
> activate py2allen
(py2allen)> pip install allensdk
(py2allen)> jupyter notebook

更多信息可以在这里找到。如果未找到某些要求，可以尝试手动安装它们。