SIGSEGV in C extension for Python

Question

我有一个用于Python的C扩展模块，它使用函数_xdr_read_xtc读取xtc轨迹。

该模块内置在 .so 库中没有问题，并且大部分时间运行良好。但是，有时我会收到"分段错误(核心转储)"。

static PyObject * _xdr_read_xtc(PyObject *self, PyObject *args)
{
int natoms;
XDRFILE *xd;
xd = (XDRFILE *) malloc(sizeof(XDRFILE));
if (xd == NULL){
return NULL;}
XDRFILE *dummy;
dummy = xd;
if (!PyArg_ParseTuple(args, "ii", &xd, &natoms)){
return NULL;
}
free(dummy);
int step = 0;
float time;
float prec;
matrix box;
rvec *x;
x = malloc(natoms * sizeof(*x));
if (x == NULL){
return NULL;}
// read frame
int status = read_xtc(xd, natoms, &step, &time, box, x, &prec);
if (status == 0 | status == 11){
npy_intp dims[2]= {natoms, 3};
PyArrayObject *matout = (PyArrayObject *) PyArray_SimpleNewFromData(2, dims, NPY_FLOAT, x);
PyArray_ENABLEFLAGS(matout, NPY_ARRAY_OWNDATA);
PyObject *Frame = Py_BuildValue("Oii", matout, status, step);
Py_DECREF(matout);
return Frame;
}
else{
free(x);
return  NULL;
}
}

使用 Valgrind 进行调试时，我得到"进程终止，默认操作为信号 11 (SIGSEGV)。访问不在地址 0x195688988' 的映射区域内：

int status = read_xtc(xd, natoms, &step, &time, box, x, &prec);

代码有什么明显的问题吗？也许是无效指针？或者可能是内存问题？

谢谢！

Answer 1

您在xd中分配内存以保存XDRFILE。然后你xd移动到dummy，解析一个整数(文件句柄？)并放入xd/dummy。然后你通过释放dummy来释放xd。然后调用将访问释放内存的read_xtc(xd, ...。如果您的内存分配器决定放弃该页面，您将获得一个SIGSEGV。

将free(dummy)移动到实际上不再需要内存的位置。