有没有JBrowse的替代软件(在Centos6上(。
我需要将一个集成到我的网页中，但是jbrowser在安装PerlIO：：gzip时给出了zlib的错误。虽然安装了所有相关模块(libpng，libpng-devel，gd-devel，zlib-devel，perl-ExtUtils-MakeMaker，Development Tools，perl-Compress-Zlib(。
任何建议都会有所帮助。 Windows8操作系统的替代方案也将起作用。
请注意，这里有一个针对 JBrowse 问题的邮件列表交叉链接 https://sourceforge.net/p/gmod/mailman/message/36349221/
JBrowse的替代品可能包括igv.js，pileup.js，genomeview或其他HTML5基因组浏览器。
另外请注意，如果我们的立场是 Perl 先决条件确实不可能安装在您的系统上，那么我们可以采取另一种方法，因为 JBrowse 实际上并不要求安装 Perl 先决条件才能运行。现代 JBrowse 可以加载本机文件格式，而无需使用 Perl 脚本进行转换。
在这种情况下，您可以简单地创建文件目录，例如
data/genome.fa
data/genome.fa.fai
data/tracks.conf
data/annotations.sorted.gff.gz
data/annotations.sorted.gff.gz.tbi
其中 genome.fa.fai 由samtools faidx genome.fa生成，annotations.sorted.gff.gz 由sort -k1,1 -k4,4n annotations.gff > annotations.sorted.gff生成，然后bgzip annotations.sorted.gff.gz，最后tabix -p vcf annotations.sorted.gff.gz
然后 tracks.conf 文件可以包含
[GENERAL]
refSeqs=genome.fa.fai
[tracks.refseq]
urlTemplate=genome.fa
storeClass=JBrowse/Store/SeqFeature/IndexedFasta
type=Sequence
[tracks.annotations]
urlTemplate=annotations.sorted.gz
type=CanvasFeatures
storeClass=JBrowse/Store/SeqFeature/GFF3Tabix
从这个意义上说，您的浏览器可以在没有perl先决条件的情况下完全创建