biojava import org.biojava 不起作用

Question

我在这里尝试使用示例：http://www.biojava.org/wiki/BioJava%3aCookbook%3aSeqIO%3aReadGESBiojavax

但是，它无法找到我使用的org.biojava导入。 我尝试下载和编辑POM.xml并将其添加到项目中，但没有任何效果。 有什么建议吗？

Answer 1

您正在查看的示例是遗留的biojava版本1.8.X的一部分。http://www.biojava.org/wiki/BioJava:CookBook

Answer 2

你在用Maven吗？如果是这种情况，您应该熟悉将其包含在您自己的pom.xml（而不是下载的）：

<dependencies>
  ...
  <dependency>
    <groupId>org.biojava</groupId>
    <artifactId>biojava3-core</artifactId>
    <version>3.0.3</version>
    </dependency>
    <!-- other biojava jars as needed -->
</dependencies>
<repositories>
  <repository>
    <id>biojava-maven-repo</id>
    <name>BioJava repository</name>
    <url>http://www.biojava.org/download/maven/</url>           
  </repository>
</repositories>

如果您不使用Maven（我和biojava人都不推荐），则可以在此处下载所需的jar文件：http://www.biojava.org/download/maven/org/biojava/但要注意：您必须自己下载并添加biojava使用的所有传递依赖项（.jar文件）。在这种情况下，我强烈建议您尝试一下Maven！

Answer 3

你需要

下载biojava.jar并将其包含在你的类路径中（你可以从这里下载它） - 请注意，.jar文件可能有一些它需要的其他必需的.jars

。

如果你有一个pom.xml，你可以将你的项目设置为与maven兼容，然后运行maven - 它将下载所有必需的.jars并正确设置类路径（如果pom文件配置正确）