bio格式的imagej/fiji宏处理

Question

我正在尝试创建一个宏，该宏将在包含图像的文件中运行循环。要打开图像，我正在使用Bio-Format导入程序，并且代码正在工作，但每次都会提示我选择文件中的图像。有没有办法让它自动在文件中运行？这是我下面的代码。。。任何帮助都将不胜感激。。

这些是我尝试过的一些其他格式，但仍然无法使其工作

run("Bio-Formats Importer", "open= + inputDirectory + fileList[i] color_mode=Default view=Hyperstack stack_order=XYCZT");
run("Bio-Formats Importer", "open(fileList) color_mode=Default rois_import=[ROI manager] split_channels view=Hyperstack stack_order=XYCZT");
run("Bio-Formats Importer", "open= + inputDirectory + fileList[i] color_mode=Default rois_import=[ROI manager] split_channels view=Hyperstack stack_order=XYCZT")
run("Bio-Formats", "open=" + fileList[i] " color_mode=Default  open_all_series rois_import=[ROI manager] split_channels view=Hyperstack stack_order=XYCZT");
run("Bio-Formats Importer", "open=["+fileList[i]+"] color_mode=Default view=Hyperstack stack_order=XYCZT series_"+d2s(j,0)); 

setBatchMode(true); 
inputDirectory = getDirectory("Choose a Directory of Image")
fileList = getFileList(inputDirectory);
for (i = 0; i < fileList.length; i++)
{
processImage(fileList[i]);
outputDirectory = "S:/Research/MLW/OUTPUT/";
outputFile = outputDirectory+fileList[i]+".csv";
saveAs("results",outputFile);
}
setBatchMode(false); 
function processImage(imageFile)
{
prevNumResults = nResults;  
run("Bio-Formats Macro Extensions"); 
run("Bio-Formats Importer", "open= + inputDirectory + fileList[i] color_mode=Default rois_import=[ROI manager] split_channels view=Hyperstack stack_order=XYCZT");  
filename = getTitle();
run("Auto Threshold", "method=Yen white");
run("Skeletonize (2D/3D)");

Answer 1

这可能很简单，只需移动setBatchMode函数中的所有内容