R:在文件夹中浏览文件并从中提取名称和数据



我需要从电子表格中提取一些数据,其中很多(超过一百多个),所以我认为使用一些R脚本进行此操作会更快。(也许这是我的第一个错误,但我想尝试使用R。

所有这些文件都位于同一文件夹中,其中大多数都有气象站或城市的名称,只有某些文件是无关紧要的。此外,它们没有所有相同的扩展名:有些是.csv,其他.xls,一些.txt,.zip或.r(这些是不需要的文件)

我想做的是浏览我的文件夹,如果与我相关,请选择文件的名称,只保留城市/站的名称,打开文件,收集信息,收集信息我需要,将其关闭并转到下一个文件。

另外,有些城市有几个站点,或者有几个文件用于同一电台。例如:

SomeCity.csv and SomeCity_1966-2001.csv
AnotherCity.station1.xls, AnotherCity.station2.xls
ACity.station.xls, ACity_1977-2005.csv
My.City.csv, My-City.csv

是的,并不总是那么简单...

在这里我目前所做的事情,我只查看.csv和.xls文件。如果存在" _",那么我只保留之前的内容,并在城市尚未在数据范围内的情况下存放它,如果没有,我只会删除扩展名以获取城市名称。我需要有有关文件扩展的这两种情况,因为内部的数据格式不相同:例如,站ID在.xls中的第一列中,而它在.csv ...中的第二列中。

# Read files names :
files_list <- list.files(path="my/path/to/files")
n_files <- length(files_list)
df_out <- data.frame(matrix(ncol = 6, nrow = n_files))
x <- c("Name","Id","Granularity","Start","End","Missing")
colnames(df_out) <- x
i=1
j=1
# Browing the list of files
while(j<n_files)
{
  file = files_list[j]
  # Case of a .csv file  :
  if(grepl(".csv",file))
  {
    if(!grepl("_",file))
    {
      df_out$Name[i] <- gsub("\.csv","",file)
      i <- i+1
    }
    else if(!any(grepl(gsub("\_.*","",file),df_out$Name)))
    {
      df_out$Name[i] <- gsub("\_.*","",file)
      i <- i+1
    }
  }
  # Case of a .xls file :
  else if(grepl(".xls",file))
  {
    if(!grepl("_",file))
    {
      df_out$Nom[i] <- gsub("\.xls","",file)
      i <- i+1
    }
    else if(!any(grepl(gsub("\_.*","",file),df_out$Name)))
    {
      df_out$Nom[i] <- gsub("\_.*","",file)
      i <- i+1
    }
  }
  j <- j+1
}
df_out <- df_out[1:i-1,]

问题:在" my.city"one_answers" my-city"的情况下,我的数据框架中的同一站中有2个不同的条目,我该如何避免?我正在考虑删除"。或" - "并将名称作为Mycity库存,看看是否已经在这里,但这对我城市的居民来说并不是很好,可以污损他们的城市名称。只是开玩笑,我只是觉得有一种更好的方法可以使用正则表达式。老实说,我觉得我所做的大多数事情都可以用正则态度来完成几行。

这是我拥有的实际文件列表:

"200601.txt"
"Abbeville.xls"
"Abbeville_1971-2005.csv"
"Agen.xls"
"Agen_1961-2005.csv"
"Ajaccio.xls"
"Ajaccio_1961-2003.csv"
"Auxerre.xls"
"Auxerre_1961-2005.csv"
"Bale-Mulhouse_1961-2005.csv"
"Bale.Mulhouse.xls"
"Beauvais_1994-2005.csv"
"Beauvais_2001-2005.csv"
"Besancon.xls"
"Besancon_1961-2005.csv"
"Biarritz.anglet.xls"
"Biarritz_1961-2005.csv"
"Bonneville.xls"
"Bordeaux.Merignac.xls"
"Bordeaux_1961-2005.csv"
"Boulogne_1994-2005.csv"
"Boulogne_2001-2005.csv"
"Bourg-St-Maurice_1994-2005.csv"
"Bourg-St-Maurice_2001-2005.csv"
"Bourges.xls"
"Bourges_1961-2005.csv"
"Brest.Guipavas.xls"
"Brest_1961-2005_sauf_1989.csv"
"Brive.xls"
"Caen.Carpiquet.xls"
"Caen_1961-2005.csv"
"Cap.de.la.Heve.Le.Havre.xls"
"Carcassonne.xls"
"Cazaux.xls"
"Chambery.Aix.xls"
"Chambery_1974-2005.csv"
"Charleville.Mezieres.xls"
"Chartres.xls"
"Chartres_1961-2005.csv"
"Clermond-Fd_1961-2005.csv"
"Clermont.Fd.xls"
"Cognac.xls"
"Cognac_1961-2005.csv"
"Colmar.xls"
"Dijon.xls"
"Dijon_1961-2005.csv"
"Dinard.xls"
"Dinard_1961-2005.csv"
"Dinard_2003-2005.csv"
"donnees_triH_1961_2005.csv
"Dunkerque.txt"
"Dunkerque_1974-2008.csv"
"Embrun.xls"
"Embrun_1961-2005.csv"
"ENVOI_METEO_20040405.zip"
"Gourdon_1994-2005.csv"
"Gourdon_2001-2005.csv"
"Grenoble.le.versoud.xls"
"Grenoble.St.Geoirs.xls"
"Grenoble.St.Martin.heres.xls"
"Grenoble_1968-2005.csv"
"historiques Bordeaux et Dinard.txt"
"Hyeres_2007-2009.csv"
"Istres.csv"
"Istres.txt"
"La-Rochelle_1961-2005.csv"
"La-Rochelle_Aerodrome_2007-2009.csv"
"La.Rochelle.xls"
"Le.Puy.xls"
"Le.Touquet.xls"
"Lille.xls"
"Lille_1961-2005.csv"
"losvari.11069001.txt"
"losvari.14137001.txt"
"losvari.17300001.txt"
"losvari.31069001.txt"
"losvari.33529001.txt"
"losvari.62826001.txt"
"losvari.64549001.txt"
"losvari.76552001.txt"
"losvari.78621001.txt"
"Luxeil.xls"
"Luxeuil_1961-2005.csv"
"Lyon.Bron.xls"
"Lyon_1961-2005.csv"
"Macon_1994-2005.csv"
"Macon_2001-2005.csv"
"Marignane.xls"
"Marignane_1961-2005.csv"
"Metz.Frescaty.xls"
"Metz_1961-2005.csv"
"Millau.xls"
"Mise_en_forme.r"
"Montelimar.xls"
"Montelimar_1961-2005.csv"
"Montpellier.xls"
"Montpellier_1961-2005.csv"
"Nantes.Bouguenais.xls"
"Nantes_1961-2005.csv"
"Nice.xls"
"Nice_1961-2005.csv"
"Nimes.Courbessac.xls"
"Nimes_1961-2005.csv"
"Orange.xls"
"Orange_1961-2005.csv"
"Orleans.xls"
"Orleans_1961-2005.csv"
"Paris_1950-2005.csv"
"Paris1.xls"
"Pau.Uzein.xls"
"Pau_03-2006.csv"
"Pau_1961-2005.csv"
"Perpignan.xls"
"Perpignan_1961-2005.csv"
"Reims.Courcy.xls"
"Reims_1961-2005.csv"
"Rennes.St.Jacques.xls"
"Rennes_1961-2005.csv"
"Rennes_1961-2005_sauf_2003-2004.csv"
"Rennes_2003-2004.csv"
"Rouen.Boos.xls"
"Rouen_1969-2005.csv"
"Saint.Brieuc.xls"
"Saint.Girons.xls"
"St-Etienne_1961-2005.csv"
"St-Girons_1961-2005.csv"
"St-Quentin_1961-2008.csv"
"St.Auban.xls"
"St.Etienne.Boutheon.xls"
"St.Quentin.xls"
"Strasbourg.Entzheim.xls"
"Strasbourg_1949-2005.csv"
"Toulon.xls"
"Toulon_1961-2005.csv"
"Toulouse.Blagnac.xls"
"Toulouse_1961-2005.csv"
"Tours.xls"
"Tours_1960-2005.csv"

这是我的代码的输出(ID很容易获得,但也许不是其余的...):

                       Name Id Granularity Start End Missing
1                 Abbeville NA          NA    NA  NA      NA
2                      Agen NA          NA    NA  NA      NA
3                   Ajaccio NA          NA    NA  NA      NA
4                   Auxerre NA          NA    NA  NA      NA
5             Bale-Mulhouse NA          NA    NA  NA      NA
6             Bale.Mulhouse NA          NA    NA  NA      NA
7                  Beauvais NA          NA    NA  NA      NA
8                  Besancon NA          NA    NA  NA      NA
9           Biarritz.anglet NA          NA    NA  NA      NA
10               Bonneville NA          NA    NA  NA      NA
11        Bordeaux.Merignac NA          NA    NA  NA      NA
12                 Boulogne NA          NA    NA  NA      NA
13         Bourg-St-Maurice NA          NA    NA  NA      NA
14                  Bourges NA          NA    NA  NA      NA
15           Brest.Guipavas NA          NA    NA  NA      NA
16                    Brive NA          NA    NA  NA      NA
17           Caen.Carpiquet NA          NA    NA  NA      NA
18  Cap.de.la.Heve.Le.Havre NA          NA    NA  NA      NA
19              Carcassonne NA          NA    NA  NA      NA
20                   Cazaux NA          NA    NA  NA      NA
21             Chambery.Aix NA          NA    NA  NA      NA
22     Charleville.Mezieres NA          NA    NA  NA      NA
23                 Chartres NA          NA    NA  NA      NA
24              Clermond-Fd NA          NA    NA  NA      NA
25              Clermont.Fd NA          NA    NA  NA      NA
26                   Cognac NA          NA    NA  NA      NA
27                   Colmar NA          NA    NA  NA      NA
28                    Dijon NA          NA    NA  NA      NA
29                   Dinard NA          NA    NA  NA      NA
30                  donnees NA          NA    NA  NA      NA
31                Dunkerque NA          NA    NA  NA      NA
32                   Embrun NA          NA    NA  NA      NA
33                  Gourdon NA          NA    NA  NA      NA
34      Grenoble.le.versoud NA          NA    NA  NA      NA
35       Grenoble.St.Geoirs NA          NA    NA  NA      NA
36 Grenoble.St.Martin.heres NA          NA    NA  NA      NA
37                   Hyeres NA          NA    NA  NA      NA
38                   Istres NA          NA    NA  NA      NA
39              La-Rochelle NA          NA    NA  NA      NA
40              La.Rochelle NA          NA    NA  NA      NA
41                   Le.Puy NA          NA    NA  NA      NA
42               Le.Touquet NA          NA    NA  NA      NA
43                    Lille NA          NA    NA  NA      NA
44                   Luxeil NA          NA    NA  NA      NA
45                  Luxeuil NA          NA    NA  NA      NA
46                Lyon.Bron NA          NA    NA  NA      NA
47                    Macon NA          NA    NA  NA      NA
48                Marignane NA          NA    NA  NA      NA
49            Metz.Frescaty NA          NA    NA  NA      NA
50                   Millau NA          NA    NA  NA      NA
51               Montelimar NA          NA    NA  NA      NA
52              Montpellier NA          NA    NA  NA      NA
53        Nantes.Bouguenais NA          NA    NA  NA      NA
54                     Nice NA          NA    NA  NA      NA
55         Nimes.Courbessac NA          NA    NA  NA      NA
56                   Orange NA          NA    NA  NA      NA
57                  Orleans NA          NA    NA  NA      NA
58                    Paris NA          NA    NA  NA      NA
59                   Paris1 NA          NA    NA  NA      NA
60                Pau.Uzein NA          NA    NA  NA      NA
61                Perpignan NA          NA    NA  NA      NA
62             Reims.Courcy NA          NA    NA  NA      NA
63        Rennes.St.Jacques NA          NA    NA  NA      NA
64               Rouen.Boos NA          NA    NA  NA      NA
65             Saint.Brieuc NA          NA    NA  NA      NA
66             Saint.Girons NA          NA    NA  NA      NA
67               St-Etienne NA          NA    NA  NA      NA
68                St-Girons NA          NA    NA  NA      NA
69               St-Quentin NA          NA    NA  NA      NA
70                 St.Auban NA          NA    NA  NA      NA
71      St.Etienne.Boutheon NA          NA    NA  NA      NA
72               St.Quentin NA          NA    NA  NA      NA
73      Strasbourg.Entzheim NA          NA    NA  NA      NA
74                   Toulon NA          NA    NA  NA      NA
75         Toulouse.Blagnac NA          NA    NA  NA      NA
76                    Tours NA          NA    NA  NA      NA

感谢您的见解和帮助。问候。

编辑:df_out $ name的预期输出:(使用ID我可以说Grenoble.st.Geoirs与Grenoble.st.martin相同,所以这就是为什么现在仍然在这里的原因。)

Abbeville
Agen
Ajaccio
Auxerre
Bale-Mulhouse
Beauvais
Besancon
Biarritz.anglet
Biarritz
Bonneville
Bordeaux.Merignac
Bordeaux
Boulogne
Bourg-St-Maurice
Bourges
Brest.Guipavas
Brest
Brive
Caen.Carpiquet
Caen
Cap.de.la.Heve.Le.Havre
Carcassonne
Cazaux
Chambery.Aix
Chambery
Charleville.Mezieres
Chartres
Clermond-Fd
Cognac
Colmar
Dijon
Dinard
Dunkerque
Embrun
Gourdon
Grenoble.le.versoud
Grenoble.St.Geoirs
Grenoble.St.Martin
Grenoble
Hyeres
Istres
La-Rochelle_Aerodrome
La-Rochelle
Le.Puy
Le.Touquet
Lille
Luxeil
Lyon.Bron
Lyon
Macon
Marignane
Metz.Frescaty
Metz
Millau
Montelimar
Montpellier
Nantes.Bouguenais
Nantes
Nice
Nimes.Courbessac
Nimes
Orange
Orleans
Paris
Paris1
Pau.Uzein
Pau
Perpignan
Reims.Courcy
Reims
Rennes.St.Jacques
Rennes
Rouen.Boos
Rouen
Saint.Brieuc
Saint.Girons
St-Etienne
St-Girons
St-Quentin
St.Auban
St.Etienne.Boutheon
Strasbourg.Entzheim
Strasbourg
Toulon
Toulouse.Blagnac
Toulouse
Tours

代码

请参阅此处使用的代码

x <- c("200601.txt","Abbeville.xls","Abbeville_1971-2005.csv","Agen.xls","Agen_1961-2005.csv","Ajaccio.xls","Ajaccio_1961-2003.csv","Auxerre.xls","Auxerre_1961-2005.csv","Bale-Mulhouse_1961-2005.csv","Bale.Mulhouse.xls","Beauvais_1994-2005.csv","Beauvais_2001-2005.csv","Besancon.xls","Besancon_1961-2005.csv","Biarritz.anglet.xls","Biarritz_1961-2005.csv","Bonneville.xls","Bordeaux.Merignac.xls","Bordeaux_1961-2005.csv","Boulogne_1994-2005.csv","Boulogne_2001-2005.csv","Bourg-St-Maurice_1994-2005.csv","Bourg-St-Maurice_2001-2005.csv","Bourges.xls","Bourges_1961-2005.csv","Brest.Guipavas.xls","Brest_1961-2005_sauf_1989.csv","Brive.xls","Caen.Carpiquet.xls","Caen_1961-2005.csv","Cap.de.la.Heve.Le.Havre.xls","Carcassonne.xls","Cazaux.xls","Chambery.Aix.xls","Chambery_1974-2005.csv","Charleville.Mezieres.xls","Chartres.xls","Chartres_1961-2005.csv","Clermond-Fd_1961-2005.csv","Clermont.Fd.xls","Cognac.xls","Cognac_1961-2005.csv","Colmar.xls","Dijon.xls","Dijon_1961-2005.csv","Dinard.xls","Dinard_1961-2005.csv","Dinard_2003-2005.csv","donnees_triH_1961_2005.csv","Dunkerque.txt","Dunkerque_1974-2008.csv","Embrun.xls","Embrun_1961-2005.csv","ENVOI_METEO_20040405.zip","Gourdon_1994-2005.csv","Gourdon_2001-2005.csv","Grenoble.le.versoud.xls","Grenoble.St.Geoirs.xls","Grenoble.St.Martin.heres.xls","Grenoble_1968-2005.csv","historiques Bordeaux et Dinard.txt","Hyeres_2007-2009.csv","Istres.csv","Istres.txt","La-Rochelle_1961-2005.csv","La-Rochelle_Aerodrome_2007-2009.csv","La.Rochelle.xls","Le.Puy.xls","Le.Touquet.xls","Lille.xls","Lille_1961-2005.csv","losvari.11069001.txt","losvari.14137001.txt","losvari.17300001.txt","losvari.31069001.txt","losvari.33529001.txt","losvari.62826001.txt","losvari.64549001.txt","losvari.76552001.txt","losvari.78621001.txt","Luxeil.xls","Luxeuil_1961-2005.csv","Lyon.Bron.xls","Lyon_1961-2005.csv","Macon_1994-2005.csv","Macon_2001-2005.csv","Marignane.xls","Marignane_1961-2005.csv","Metz.Frescaty.xls","Metz_1961-2005.csv","Millau.xls","Mise_en_forme.r","Montelimar.xls","Montelimar_1961-2005.csv","Montpellier.xls","Montpellier_1961-2005.csv","Nantes.Bouguenais.xls","Nantes_1961-2005.csv","Nice.xls","Nice_1961-2005.csv","Nimes.Courbessac.xls","Nimes_1961-2005.csv","Orange.xls","Orange_1961-2005.csv","Orleans.xls","Orleans_1961-2005.csv","Paris_1950-2005.csv","Paris1.xls","Pau.Uzein.xls","Pau_03-2006.csv","Pau_1961-2005.csv","Perpignan.xls","Perpignan_1961-2005.csv","Reims.Courcy.xls","Reims_1961-2005.csv","Rennes.St.Jacques.xls","Rennes_1961-2005.csv","Rennes_1961-2005_sauf_2003-2004.csv","Rennes_2003-2004.csv","Rouen.Boos.xls","Rouen_1969-2005.csv","Saint.Brieuc.xls","Saint.Girons.xls","St-Etienne_1961-2005.csv","St-Girons_1961-2005.csv","St-Quentin_1961-2008.csv","St.Auban.xls","St.Etienne.Boutheon.xls","St.Quentin.xls","Strasbourg.Entzheim.xls","Strasbourg_1949-2005.csv","Toulon.xls","Toulon_1961-2005.csv","Toulouse.Blagnac.xls","Toulouse_1961-2005.csv","Tours.xls","Tours_1960-2005.csv")
x <- gsub("^\p{Ll}.*$|(?:[_.]\d.*|(?:^\d+)?\.[^.]+)$", "", x, perl=TRUE)
x <- x[x != ""]
y <- gsub("[\W_]", "", x, perl=TRUE)
x[-which(duplicated(y))]

变化

这些变化基于OP的特定要求。有关每个变化的更多详细信息,请参阅结果下的差异。下面的方法可以组合以使它们满足多个差异。

方法1

添加|^[p{Lu}_d]+以匹配从字符串开始到扩展名的大写字母,下划线和数字的任何组合。

^p{Ll}.*$|(?:[_.]d.*|(?:^d+|^[p{Lu}_d]+)?.[^.]+)$

方法2

添加 |^p{L}+(?:_p{L}+)+以匹配任何字母或多次,然后是一个或多个[下划线,然后是一个或多个字母]

^p{Ll}.*$|(?:[_.]d.*|(?:^d+|^p{L}+(?:_p{L}+)+)?.[^.]+)$

结果

注意:下面的结果集与您的预期输出之间存在一些差异。

差异

  • Clermont.Fd:这是因为Clermond != Clermontd vs t)。
  • ENVOI_METEO:请参见变化方法1 ,但它可能对有效名称产生负面后果,因此我已经完成了此 fix fix 可选通过将其排除在答案的实际代码中。
  • Grenoble.St.Martin.heres:您的一些输入包括.之后的小写字母(请参阅Cap.de.la.Heve.Le.HavreGrenoble.le.versoudBiarritz.anglet)。我不确定您想如何将其与其他结果区分开。
  • Luxeuil:与Luxeil不一样,所以我不删除它。
  • Mise_en_forme:其他有效条目包括_(请参阅La-Rochelle_Aerodrome),因此我不确定从结果集中删除此值的前提是什么。如果是因为它不包含任何.-字符,则可以在 variations 上使用模式:方法2

输出

Abbeville
Agen
Ajaccio
Auxerre
Bale-Mulhouse
Beauvais
Besancon
Biarritz.anglet
Biarritz
Bonneville
Bordeaux.Merignac
Bordeaux
Boulogne
Bourg-St-Maurice
Bourges
Brest.Guipavas
Brest
Brive
Caen.Carpiquet
Caen
Cap.de.la.Heve.Le.Havre
Carcassonne
Cazaux
Chambery.Aix
Chambery
Charleville.Mezieres
Chartres
Clermond-Fd
Clermont.Fd
Cognac
Colmar
Dijon
Dinard
Dunkerque
Embrun
ENVOI_METEO
Gourdon
Grenoble.le.versoud
Grenoble.St.Geoirs
Grenoble.St.Martin.heres
Grenoble
Hyeres
Istres
La-Rochelle
La-Rochelle_Aerodrome
Le.Puy
Le.Touquet
Lille
Luxeil
Luxeuil
Lyon.Bron
Lyon
Macon
Marignane
Metz.Frescaty
Metz
Millau
Mise_en_forme
Montelimar
Montpellier
Nantes.Bouguenais
Nantes
Nice
Nimes.Courbessac
Nimes
Orange
Orleans
Paris
Paris1
Pau.Uzein
Pau
Perpignan
Reims.Courcy
Reims
Rennes.St.Jacques
Rennes
Rouen.Boos
Rouen
Saint.Brieuc
Saint.Girons
St-Etienne
St-Girons
St-Quentin
St.Auban
St.Etienne.Boutheon
Strasbourg.Entzheim
Strasbourg
Toulon
Toulouse.Blagnac
Toulouse
Tours

说明

  • x <- gsub("^\p{Ll}.*$|(?:[_.]\d.*|(?:^\d+)?\.[^.]+)$", "", x, perl=TRUE)一无所获。
    • ^p{Ll}.*$|(?:[_.]d.*|(?:^d+)?.[^.]+)$匹配以下任意
      • ^p{Ll}.*$匹配以下(这删除donnes...hsitorique...,因为它们以小写字母开头)
        • ^在线开始时断言位置
        • p{Ll}匹配任何语言(Unicode)的任何小写字母
        • .*匹配任何字符的任何次数
        • $在行末尾断言位置
      • (?:[_.]d.*|(?:^d+)?.[^.]+)$匹配以下(这删除了以下数字,文件扩展名和仅数字命名的文件的下划线或点)
        • (?:[_.]d.*|(?:^d+)?.[^.]+)匹配以下任一两种
          • [_.]d.*匹配以下
            • [_.]匹配集合中的任何字符(下划线或点)
            • d匹配数字
            • .*匹配任何字符的任何次数
          • (?:^d+)?.[^.]+匹配以下
            • (?:^d+)?匹配以下零或一次
              • ^在线开始时断言位置
              • d+匹配一个或多个数字
            • .匹配一个点字面上
            • [^.]+匹配集合中不存在的任何字符(DOT之外的任何字符)一次或多次
        • $在行末端断言位置
  • x <- x[x != ""]从矢量x
  • 删除空字符串
  • y <- gsub("[\W_]", "", x, perl=TRUE)复制x,同时替换所有不是单词字符的字符,也没有什么都没有。另外(或者,如果对您不总是有用),则可以使用[^p{L}p{N}](与任何语言/脚本 - Unicode中的字母或数字不匹配的任何字符)。
    • 例如:
      • Bale-Mulhouse变为BaleMulhouse
      • Bale.Mulhouse变为BaleMulhouse
  • x[-which(duplicated(y))]删除了在y中发现重复值的索引(在删除非alphanumeric字符之后)。
    • 例如(请参阅最后一个项目符号的示例BaleMulhouse):
      • BaleMulhouse重复被删除。重复项定义为所有重复 因此,仅保留一组重复的第一组。

相关内容

  • 没有找到相关文章

最新更新