在awk中平均多个列,不包括空值



我需要平均该文件中的所有列从第3列到最后一个,不包括第1行:表

jd h 3 5 8 10 11 14 15
79 1 52.0 51.0 58.0 45.0 59.0 20.0 27
79 2 52.0 51.0 58.0 45.0 59.0 20.0 -999.0
79 3 52.0 51.0 58.0 45.0 59.0 20.0 -999.0
79 4 -999.0 51.0 58.0 45.0 59.0 20.0 -999.0

chet转录的数据

此脚本正常:

cat myfile.txt | awk ' NR>1{for (i=3;i<=NF;i++){a[i]+=$i;}} END {for (i=3;i<=NF;i++) {print a[i]/(NR-1)}}' > myoutput.txt

问题在于,在列中,我的空值(标记为" -999.0"),我想从平均值中排除。

任何建议都会有所帮助。

awk 'NR > 1 { for (i = 3; i <= NF; i++) if ($i != -999.0) { sum[i] += $i; num[i]++; } }
     END    { for (i = 3; i <= NF; i++) print i, sum[i], num[i], sum[i]/num[i] }' 
    myfile.txt > myoutput.txt

这仅计数有效的字段值,并分别计算每个列的行数。末端的打印标识字段,原始数据(总数)和平均值。

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