在没有互联网访问权限的 AWS-VPC 上运行 R-Notebook

Question

我在无法访问互联网的 AWS-VPC 上运行 RStudio-server。当我尝试打开一个新的R-Notebook时，它卡在加载轮屏幕上。我有两个假设：

1. RStudio 尝试连接到互联网（出于某种原因）。既然不能，它就会卡住;
2. 依赖关系问题。

其他一切正常（普通 R 脚本）。

为 RStudio 提供服务的计算机是装有 Ubuntu 16 的 EC2 实例，我正在通过同一 VPC 中的 Windows Server 2008 实例进行连接。

有什么替代假设吗？

Answer 1

两者

兼而有之。它可能缺少依赖项，因此它会尝试连接到互联网以下载它们。等待发生在等待来自远程服务器的响应之前超时时。

rmarkdown具有以下依赖项：

• 工具
• 实用工具
• 针织 （≥ 1.14）
• 亚姆 （≥ 2.1.5）
• HTML工具 （≥ 0.3.5）
• caTools
• 评估 （≥ 0.8）
• base64enc
• JSONLITE
• rprojroot
• 方法

如果您等待它超时，它会告诉您缺少哪些包。

可以通过设置来缓解等待时间：

options(repos = NULL)

这将立即带来错误消息（并停止 URI 查找）

我还没有尝试将存储库设置为指向本地 CRAN 存储库（使用 miniCRAN 制作），但最安全的方法是将其设置为 NULL，然后通过 R CMD INSTALL <package.tar.gz> 手动安装缺少的存储库