r语言 - 获取 RStudio 服务器开源版本以使用替代 gcc 版本

Question

我在RHEL7机器上安装了RStudio Server的开源版本。由于我需要安装需要比提供的版本（4.8.5）更新的 gcc/g++ 版本的 R 包，因此我通过红帽开发人员工具集安装了 5.3.1。

无论如何，我无法让RStudio服务器使用较新的gcc版本。我试图将source scl_source enable devtoolset-4附加到.bash_profile的末尾，并设置CC, CXX和COLLECT_LTD_WRAPPER环境。变量在我的主目录中的 Makevars 文件以及 $R_HOME/etc/Renviron.site 文件中。在 RStudio 服务器中运行system("gcc -v")仍然显示 gcc 版本是 4.8.5。但是，如果 ssh 进入服务器并从那里运行 R，然后检查 gcc 版本，它使用正确的版本（5.3.1）。

如何让 RStudio 服务器中的 R 会话使用较新的 GCC 版本？

Answer 1

将包含新版本的 gcc bin 的 PATH var 放在 $R_HOME/etc/Renviron.site像这样的东西..

PATH=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin:/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin

然后全局设置

您还可以在 R-studio 中按会话设置它

Sys.setenv("PATH"="/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin:/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin")

Answer 2

安装 devtoolset。

yum install centos-release-scl
yum install devtoolset-8-gcc devtoolset-8-gcc-c++

将以下内容添加到~/.R/Makevars 。

CC=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/gcc
CXX=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++11
CXX11=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++11
CXX14=/opt/rh/devtoolset-8/root/usr/bin/g++ -std=c++1y
CXX14FLAGS=-O3 -march=native -mtune=native -fPIC