>我有一个 tibble 作为:
# A tibble: 2 × 2
read_seq unique_id
<chr> <dbl>
1 AATTGGCC 1
2 GGGTTT 2
我想创建一个包含与read_seq大小相同的字符串的新变量。我这样做了,但有一个错误:
> r %>% mutate(y=paste(rep("H",width(read_seq)),sep=""))
Error in mutate_impl(.data, dots) : argument 'times' incorrect
当我只尝试捕捉宽度read_seq它有效时:
> r %>% mutate(y=width(read_seq))
# A tibble: 2 × 3
read_seq unique_id y
<chr> <dbl> <int>
1 AATTGGCC 1 8
2 GGGTTT 2 6
这是重现性示例的 dput((:
r <- structure(list(read_seq = c("AATTGGCC", "GGGTTT"), unique_id = c(1,
2)), class = c("tbl_df", "tbl", "data.frame"), row.names = c(NA,
-2L), .Names = c("read_seq", "unique_id"))
错误来自rep
,times
参数需要为 1 或与x
相同的长度,但这里不是这种情况:
rep("H", c(1,2))
Error in rep("H", c(1, 2)) : invalid 'times' argument
您可以改用strrep
,它会根据需要回收x
和times
:
r %>% mutate(y = strrep("H",nchar(read_seq)))
# A tibble: 2 x 3
# read_seq unique_id y
# <chr> <dbl> <chr>
#1 AATTGGCC 1 HHHHHHHH
#2 GGGTTT 2 HHHHHH
或者,如果您需要一些大小相等的随机字符串,请使用stringi::stri_rand_strings
:
r %>% mutate(y = stri_rand_strings(length(read_seq), nchar(read_seq)))
# A tibble: 2 x 3
# read_seq unique_id y
# <chr> <dbl> <chr>
#1 AATTGGCC 1 H0flAbNS
#2 GGGTTT 2 QrQOLj