r语言 - 重新编码时间序列数据，为每个人创建时间 0

Question

我正在尝试重新编码每 2 小时收集的一些数据，以便找到每个 ID 的起点(即当 obs 不等于零时，即该时间点有数据(，将其称为时间 0，然后对于每个后续时间点称为 2、4、6 等。

例如

    ID <- c("f1", "f1", "f1", "f1", "f2", "f2", "f2", "f2", "f3", "f3", "f3", "f3")
    time <- rep(c(66, 68, 70, 72), 3)
    obs <- c(1, 3, 5, 6, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 3, 3)
    new.time <- c(0, 2, 4, 6, NA, NA, 0, 2, NA, 0, 2, 4)
    data <- as.data.frame(cbind(ID, time, obs, new.time))

希望数据框有效

我有ID，时间和obs，但我想创建"新时间" - 任何帮助，特别是dplyr解决方案

Answer 1

1(我们在最后的注释中将data定义为data.frame而不是矩阵，然后使用ave设置new.time：

不使用包装。

make_no <- function(obs) c(rep(NA, sum(obs == 0)), seq(0, length = sum(obs != 0), by = 2))
transform(data, new.time = ave(obs, ID, FUN = make_no))

给：

   ID time obs new.time
1  f1   66   1        0
2  f1   68   3        2
3  f1   70   5        4
4  f1   72   6        6
5  f2   66   0       NA
6  f2   68   0       NA
7  f2   70   3        0
8  f2   72   4        2
9  f3   66   0       NA
10 f3   68   1        0
11 f3   70   3        2
12 f3   72   3        4

2( 或使用 DPLYR：

data %>%
  group_by(ID) %>%
  mutate(new.time = make_no(obs)) %>%
  ungroup

注意

ID <- c("f1", "f1", "f1", "f1", "f2", "f2", "f2", "f2", "f3", "f3", "f3", "f3")
time <- rep(c(66, 68, 70, 72), 3)
obs <- c(1, 3, 5, 6, 0, 0, 3, 4, 0, 1, 3, 3)
data <- data.frame(ID, time, obs)

Answer 2

我们可以创建一个自定义函数并按组应用它，即

f1 <- function(x) {
    x1 <- length(x[x != 0])
    i1 <- seq(0, length.out = x1, by = 2)
    i2 <- c(rep(NA, (length(x) - x1)),i1)
    return(i2)
}
#Using `dplyr` to apply it,
library(dplyr)
df %>% 
 group_by(ID) %>% 
 mutate(new = f1(obs))

这给了，

# A tibble: 12 x 4
# Groups:   ID [3]
   ID    time  obs     new
   <fct> <fct> <fct> <dbl>
 1 f1    66    1         0
 2 f1    68    3         2
 3 f1    70    5         4
 4 f1    72    6         6
 5 f2    66    0        NA
 6 f2    68    0        NA
 7 f2    70    3         0
 8 f2    72    4         2
 9 f3    66    0        NA
10 f3    68    1         0
11 f3    70    3         2
12 f3    72    3         4