Fortran & Matlab 链接 -- 未定义的符号



我继承了这段用fortran 90编写的mex代码,但我无法正确构建。所有的对象文件都编译得很好,但是链接失败了。幸运的是,我有几个线索可以继续解决这个问题。

链接器唯一的投诉是

Undefined symbols for architecture x86_64:
"_mxgetstring_", referenced from:
_mexfunction_ in qgstep_mex.o
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64

现在mxGetString只在qgstep_mex.f90中的一个位置被调用

status = mxGetString(prhs(3), prmfname, STRLEN)

所以如果我把它改成

status = 0

和硬编码prmfname,该包构建得很好。但我当然不想硬编码。

然而,我已经设法构建了另一个使用mxGetString()的程序,即Matlab提供的示例文件revord.f

这两个程序由mex 发出的相同命令链接

gcc -O -Wl,-twolevel_namespace -undefined error -arch x86_64 -Wl,-syslibroot,/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.8.sdk/ -mmacosx-version-min=10.5 -bundle -Wl,-exported_symbols_list,/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/lib/maci64/fexport.map  -o  "revord.mexmaci64"  revord.o  -L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -L/opt/local/lib/gcc47/gcc/x86_64-apple-darwin12/4.7.3/../../.. -lgfortran -L/opt/local/lib/gcc47/gcc/x86_64-apple-darwin12/4.7.3 -lgfortranbegin

除了CCD_ 6被CCD_。

revord.F中有一个include语句

#include "fintrf.h"

在编译过程中由标志指向

-I/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/include

然而,如果我试图将其放在qgstep_mex.f90中,链接器只会抱怨

Warning: qgstep_mex.f90:1: Illegal preprocessor directive.

那么,有人知道如何做到这一点吗?

更新(回应M.S.B.的回答)

将扩展名的大小写更改为。F90没有效果,但-cpp标志似乎起到了作用。然而,现在它给出了一个我不太理解的错误(在编译过程中,而不是链接)(我对Fortran不太熟悉)

$ gfortran-mp-4.7 -c -I/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/include -I/Applications/MATLAB_R2012a.app/simulink/include -fexceptions -m64 -fbackslash -DMX_COMPAT_32 -O -cpp "qgstep_mex.f90"
qgstep_mex.f90:102.11:
status = mxGetString700(prhs(3), prmfname, STRLEN)
1
Error: Function 'mxgetstring700' at (1) has no IMPLICIT type

include文件中的相关行似乎是

#if defined(MX_COMPAT_32)
.
.
.
#define mxGetString mxGetString700

根据M.S.B.的更新进行更新

啊哈。看来我根本不应该包括fintrf.h。项目目录中还有另一个文件mexf90.f90,其中包含

module mexf90_mod
interface
function mxGetString(p, string, STRLEN)
integer(8) :: mxGetString
integer(8) :: p
character*(*) :: string
integer(4) :: STRLEN
end function mxGetString
function mxGetPr(pm)
integer(8), pointer :: mxGetPr
integer(8) :: pm
end function mxGetPr
.
.

奇怪的是,在qgstep_mex.f90中,mxGetPr在mxGetString之前被调用得很好,但调用mxGetString失败,错误消息如上所述。这是我使用的链接命令(为了清晰起见插入换行符)

gfortran-mp-4.7 -O -Wl,-twolevel_namespace -undefined error -arch x86_64
-Wl,-syslibroot,/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.8.sdk/
-mmacosx-version-min=10.5 -bundle -Wl,-exported_symbols_list,/Applications/MATLAB_R2012a.app/extern/lib/maci64/fexport.map
-o "QG_step_f.mexmaci64" utils.o parameters.o helmholtz.o calc.o qgflux.o qgstep.o mexf90.o qgstep_mex.o
-L/Applications/MATLAB_R2012a.app/bin/maci64 -lmx -lmex -lmat -L/opt/local/lib/gcc47/gcc/x86_64-apple-darwin12/4.7.3/../../..
-lgfortran -L/opt/local/lib/gcc47/gcc/x86_64-apple-darwin12/4.7.3 -lgfortranbegin

可以看出,对象文件的顺序似乎也是正确的。

更新

该包在linux系统上构建得很好。因此,我想编译器之间一定存在一些差异。以下是linux系统上使用的链接代码:

gfortran -O  -pthread -shared -Wl,--version-script,/ufs/local/matlab-2012a/extern/lib/glnxa64/fexport.map -Wl,--no-undefined
-o  "QG_step_f.mexa64"  utils.o parameters.o helmholtz.o calc.o qgflux.o qgstep.o mexf90.o qgstep_mex.o
-Wl,-rpath-link,/ufs/local/matlab-2012a/bin/glnxa64 -L/ufs/local/matlab-2012a/bin/glnxa64 -lmx -lmex -lmat -lm

尝试将文件名qgstep_mex.f90更改为qgstep_mex。F90.这将导致gfortran运行C预处理器。还有一个编译器选项会导致这种情况。

编辑以回应问题更新:编译器希望函数mxGetString7001是类型化的。有几种方法可以做到这一点。理想的方法是将函数的源代码放在模块中。然后,当调用方use调用该模块时,编译器就会知道函数的返回类型及其参数的类型。也许这是存在的,您需要将源代码文件添加到编译语句中。。。在使用此函数的文件之前。如果没有,您可以编写一个interface块来提供此信息。或者,您可以声明函数并使用external语句,但这实际上是一种变通方法,使用FORTRAN 77方法。

fortran中的include语句没有#

include "fintrf.h"

在构建时,为什么不使用gfortran而不是gcc呢。省去了编译器必须弄清楚您正在编译的内容。

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