Converting Eigen::SparseMatrix<double> to deal.ii ::Sp

Question

这是一个晦涩的问题，我并不真正希望有人回答，但是我有这种方法（并返回）eigen :: sparsematrix。我想将其放入Deal.ii库中，是否可以从Deal.ii/eigen复制/转换sparsematrix？我知道您可以将Deal.ii复制到Trilinos Sparsematrix类似：

  `SparseMatrix<double> matrix(sparsity);
...//fill matrix
  Epetra_Map map(TrilinosWrappers::types::int_type(5),
                 TrilinosWrappers::types::int_type(5),
                 0,
                 Utilities::Trilinos::comm_world());
  TrilinosWrappers::SparseMatrix tmatrix;
  tmatrix.reinit (map, map, matrix, 0, false);`    

eigen :: sparsematrix是否有类似的方式？我猜艾吉（Eigen）在Deal.ii中确实没有这种支持。因此，也许有一些"蛮力"类型的方法，例如这种代码的尝试显然不起作用：

`

Eigen::SparseMatrix<double> ConvertToEigenMatrix(SparseMatrix<double> data)
{
    Eigen::SparseMatrix<double> eMatrix(data.m(), data.n());
    for (int i = 0; i < data.m(); ++i)
        eMatrix.row(i) =  Eigen::SparseMatrix<double> ::Map(&data[i][0], data.n());
    return eMatrix; 

`

好吧，所以我想出了如何从dealii :: sparsematrix-> eigen :: sparsematrix。

转换。

  SparseMatrix<double>::iterator smi = matrix.begin();
  SparseMatrix<double>::iterator smi_end = matrix.end();
  unsigned int row,col;
  double val;
  for (; smi!=smi_end; ++smi)
  {
       row = smi->row();
       col = smi->column();
       val = smi->value();
       spMat.insert(row, col) = val; 
       std::cout << val << std::endl; 
  }

不，我只需要找出反面。

Answer 1

这个问题是旧的，但也许我仍然可以帮忙。我是Deal.ii开发人员，我不记得在邮件列表中看到此内容（这对这些类型的问题比这要活跃得多）。

deal.ii中的 SparseMatrix不存储其自己的稀疏模式：相反，它存储了一个指向SparsityPattern对象的指针。您需要两次循环在特征矩阵上：一次设置SparsityPattern，然后第二次复制矩阵值。如下所示，似乎有效：

#include <deal.II/lac/dynamic_sparsity_pattern.h>
#include <deal.II/lac/sparsity_pattern.h>
#include <deal.II/lac/sparse_matrix.h>
#include <eigen3/Eigen/Sparse>
#include <iostream>
int main()
{
  const std::size_t shape = 3;
  Eigen::SparseMatrix<double> matrix(shape, shape);
  matrix.insert(0, 0) = 1.0;
  matrix.insert(0, 1) = 2.0;
  matrix.insert(0, 2) = 1.0;
  matrix.insert(2, 2) = 2.0;
  matrix.makeCompressed();
  {
    dealii::SparsityPattern sparsity_pattern(matrix.rows(), matrix.cols());
    dealii::DynamicSparsityPattern dynamic_sparsity_pattern(matrix.rows(), matrix.cols());
    for (decltype(matrix.outerSize()) row_n = 0; row_n < matrix.outerSize(); ++row_n)
      for (Eigen::SparseMatrix<double>::InnerIterator it(matrix, row_n); it; ++it)
        dynamic_sparsity_pattern.add(it.row(), it.col());
    sparsity_pattern.copy_from(dynamic_sparsity_pattern);
    dealii::SparseMatrix<double> matrix2(sparsity_pattern);
    for (decltype(matrix.outerSize()) row_n = 0; row_n < matrix.outerSize(); ++row_n)
      for (Eigen::SparseMatrix<double>::InnerIterator it(matrix, row_n); it; ++it)
        matrix2.set(it.row(), it.col(), it.value());
    matrix2.print(std::cout); // prints the right matrix
  }
}

您也必须管理SparsityPattern对象的寿命。

Deal.ii不使用CSR或CSC：它使用其自己的类似CSR的格式，其中主角上的条目首先存储在包含该行的矩阵条目的数组中，因此我们确实需要使用迭代器接口。