我在一个文件夹中有一组文件。每个组由文件名中的字符3-6标识。我想读入组中的所有文件,计算有多少文件,然后将文件名分配给一个由一些字母和计数器组成的变量。例如FILENAME$COUNTER。我的代码几乎可以工作了,但将计数器分配给变量名似乎有问题。
我收到代码为FILE$COUNTER=$i
的线路的此错误
line 12: FILE1=5_lib1ln1_BWA_ddrot_testonl_pe12.bam: command not found
这正是我想要的变量名称和赋值,但找不到它的saying命令。我不知道为什么找不到命令。
#!/bin/bash
## All files from the same group have the same LIB
LIB='lib1'
COUNTER=0
for i in 5_*.bam
do
SAMPLIB=`echo $i | cut -c 3-6`
if [ "$LIB" = "$SAMPLIB" ]; then
let COUNTER++
FILE$COUNTER=$i
fi
NUMFILES=$COUNTER
done
更换
FILE$COUNTER=$i
带有
eval FILE$COUNTER=$i
有关详细信息,请参阅Bash中的eval命令及其典型用法。