图形工具GraphML支持彩色顶点?

Question

我正在尝试使用图形工具绘制带有彩色顶点的网络图。我正在尝试从下面显示以下图形ML文件。

但是，颜色不显示以下代码：

g = Graph()
g= load_graph("filename.graphml", fmt="graphml")
graph_draw(g)

图形将呈现，但顶点上没有颜色，仅适用于默认红色。我以为 graphML 是完全支持的？

Graph-tool docs指出："唯一能够完美保留内部属性映射的文件格式是"gt"和"graphml"。因此，应尽可能优先于其他格式。

颜色不是内在属性吗？

通常，我正在DOT中绘图。我有一个颜色数组，其索引取决于节点的名称 - 节点是按递增顺序排列的整数。但是，当我使用时：

for v in g.vertices():
v_prop[v] = colourarray[vertex]

颜色与正确的节点不对应。这是因为load_graph似乎对哪些节点是哪个索引有自己的想法。有人知道我能在这里做什么吗？

<graphml xmlns="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://graphml.graphdrawing.org/xmlns http://graphml.graphdrawing.org/xmlns/1.0/graphml.xsd">
<key id="d0" for="node" attr.name="color" attr.type="string">
<default>yellow</default>
</key>
<key id="d1" for="edge" attr.name="weight" attr.type="double"/>
<graph id="G" edgedefault="undirected">
<node id="n0">
<data key="d0">green</data>
</node>
<node id="n1"/>
<node id="n2">
<data key="d0">blue</data>
</node>
<node id="n3">
<data key="d0">red</data>
</node>
<node id="n4"/>
<node id="n5">
<data key="d0">turquoise</data>
</node>
<edge id="e0" source="n0" target="n2">
<data key="d1">1.0</data>
</edge>
<edge id="e1" source="n0" target="n1">
<data key="d1">1.0</data>
</edge>
<edge id="e2" source="n1" target="n3">
<data key="d1">2.0</data>
</edge>
<edge id="e3" source="n3" target="n2"/>
<edge id="e4" source="n2" target="n4"/>
<edge id="e5" source="n3" target="n5"/>
<edge id="e6" source="n5" target="n4">
<data key="d1">1.1</data>
</edge>
</graph>
</graphml>

Answer 1

您将属性映射的存在与实际用于绘制的属性映射混为一谈。如果要使用属性映射，则必须显式执行此操作：

graph_draw(g, vertex_fill_color=g.vp.color)

请查看文档，其中包含许多此类示例。

点和图形文件中存在的固有顶点"名称"作为内部属性映射加载。在点的情况下，属性映射命名为"vertex_name"：

g.vp.vertex_name

在 GraphML 的情况下，如果顶点标签不是规范的(即从 0 到 N-1 编号(，则存储为"_graphml_vertex_id"：

g.vp._graphml_vertex_id