如何筛选 .csv 文件中所有条目均为 0 但不考虑第一列的行

Question

我有一个非常大的.csv文件，看起来像：

transcript_id,C3_MAR10,C4_APR10,CRL_2APR10,CRL_1_15JUL11,CRL_2_15JUL11,C1_OCT09,CRL_6OCT11,CRL_13DEC11,CRL_3DEC11,LRV6OCT11_A,LRV6OCT11_B 
comp1000201_c0_seq1,0,5,0,0,0,0,0,0,0,0,0 
comp1000297_c0_seq1,0,7,0,0,0,0,15,7,0,0,0 
comp100036_c0_seq1,1,0,0,0,0,0,10,0,0,0,0 
comp10003_c1_seq1,0,2,0,0,0,0,0,0,0,0,0 
comp100041_c0_seq1,0,3,0,0,0,0,4,0,0,0,0 
comp100041_c0_seq2,0,0,0,0,0,0,0,19,0,0,0 
comp100041_c0_seq3,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0

我想过滤/删除所有值均为 0 但不考虑第一列的所有行。当然，我希望第一列（我剩余行的成绩单 ID）在我的输出文件中。

我试图使用：

sed '/[^0,]/!d' file.csv > filtered_file.csv

但我没有过滤任何东西，因为我所有的第一个条目都≠到 0。我不知道怎么说"我只想从第 2 列过滤到 12 列"。

有什么建议吗？

谢谢！

Answer 1

试试这个

awk -F',' 'NR>1{for (i=2;i<=NF;i++){sum +=$i}if (sum>0) print $0;sum=0}' csv

Answer 2

你可以尝试这样的事情：

awk -F, 'NR>1{for(i=2;i<=NF;i++)if($i!=0){print $0;break}else continue;next}1' csv

输出：

$ awk -F, 'NR>1{for(i=2;i<=NF;i++)if($i!=0){print $0;break}else continue;next}1' csv
transcript_id,C3_MAR10,C4_APR10,CRL_2APR10,CRL_1_15JUL11,CRL_2_15JUL11,C1_OCT09,CRL_6OCT11,CRL_13DEC11,CRL_3DEC11,LRV6OCT11_A,LRV6OCT11_B 
comp1000201_c0_seq1,0,5,0,0,0,0,0,0,0,0,0 
comp1000297_c0_seq1,0,7,0,0,0,0,15,7,0,0,0 
comp100036_c0_seq1,1,0,0,0,0,0,10,0,0,0,0 
comp10003_c1_seq1,0,2,0,0,0,0,0,0,0,0,0 
comp100041_c0_seq1,0,3,0,0,0,0,4,0,0,0,0 
comp100041_c0_seq2,0,0,0,0,0,0,0,19,0,0,0 

Answer 3

这是另一种方法：

awk '{f=$0;sub(/[^,]*/,"",f);gsub(/,/,"",f)} f' file
transcript_id,C3_MAR10,C4_APR10,CRL_2APR10,CRL_1_15JUL11,CRL_2_15JUL11,C1_OCT09,CRL_6OCT11,CRL_13DEC11,CRL_3DEC11,LRV6OCT11_A,LRV6OCT11_B
comp1000201_c0_seq1,0,5,0,0,0,0,0,0,0,0,0
comp1000297_c0_seq1,0,7,0,0,0,0,15,7,0,0,0
comp100036_c0_seq1,1,0,0,0,0,0,10,0,0,0,0
comp10003_c1_seq1,0,2,0,0,0,0,0,0,0,0,0
comp100041_c0_seq1,0,3,0,0,0,0,4,0,0,0,0
comp100041_c0_seq2,0,0,0,0,0,0,0,19,0,0,0

它测试所有值加在一起是否与0不同