BRATS17 arguments for net_run

Question

晚上好，我正在尝试使用NiftyNet的级联卷积网络重现Wang等人的结果。然而，当试图用：

net_run train -c train_whole_tumor_sagittal.ini --app brats_segmentation.BRATSApp --name anisotropic_nets.wt_net.WTNet

它确实启动了brats_segmentation应用程序并创建了csv，但是我随后收到以下错误：

Traceback (most recent call last):
File "/home/anaconda3/envs/NiftyNet/bin/net_run", line 11, in <module>
sys.exit(main())
File "/home/anaconda3/envs/NiftyNet/lib/python3.5/site-packages/niftynet/__init__.py", line 114, in main
app_driver.initialise_application(system_param, input_data_param)
File "/home/anaconda3/envs/NiftyNet/lib/python3.5/site-packages/niftynet/engine/application_driver.py", line 185, in initialise_application
data_param, app_param, data_partitioner)
TypeError: initialise_dataset_loader() takes from 1 to 3 positional arguments but 4 were given

我不知道如何解决这个问题！因此，欢迎各种帮助。此致敬意

保罗

Answer 1

似乎

net_run正在调用旧版本的brats_segmentation应用程序。

使用最新模型动物园版本的应用程序应该可以工作，请参阅自述文件：https://cmiclab.cs.ucl.ac.uk/CMIC/NiftyNetExampleServer/blob/master/anisotropic_nets_brats_challenge_model_zoo.md