R - DPLYR:为组中的重复值添加抖动

Question

我有一些分组的数字数据（value）分组（按Tissue）。我想为每个组中多次出现的值添加一个小抖动。

输入：

df <- structure(list(value = c(1.05155243861439, 
1.05155243861439, 1.05155243861439, 11.9769249796958, 1.05155243861439, 
1.05155243861439, 1.05155243861439, 1.05155243861439, 1.05155243861439
), Tissue = structure(c(5L, 5L, 5L, 4L, 5L, 3L, 5L, 1L, 1L
), .Label = c("Brain", "Marrow", "Spleen", "Testes", "Vis"), class = "factor")), .Names = c("value", 
"Tissue"), row.names = c("SM-2", "SM-3", "SM-4", "SM-5", 
"SM-6", "SM-7", "SM-8", "SM-9", "SM-10"), class = "data.frame")

我尝试使用 group_by 和 mutate ，但这会为每个组的每个重复元素添加相同的抖动（有点毫无意义，对吧？

df <- df %>%
    group_by(Tissue, value) %>%
    mutate(jitter = ifelse(n()>1, value+runif(1, min=-0.15, max=0.15), value))

输出：

Source: local data frame [9 x 3]
Groups: Tissue, value [4]
      value Tissue     jitter
      (dbl) (fctr)      (dbl)
1  1.051552    Vis  1.1793382
2  1.051552    Vis  1.1793382
3  1.051552    Vis  1.1793382
4 11.976925 Testes 11.9769250
5  1.051552    Vis  1.1793382
6  1.051552 Spleen  1.0515524
7  1.051552    Vis  1.1793382
8  1.051552  Brain  0.9284923
9  1.051552  Brain  0.9284923

第 4 行和第 6 行正确取消抖动。但是行[1-3,5,7]我希望有独特的紧张情绪。更擅长dplyr的人有什么想法吗？:(

Answer 1

正如注释中指出的那样，在这种情况下ifelse()是有问题的，因为它返回的内容的长度必须与测试的长度相同。由于测试的长度为 1，因此ifelse不会返回长度n()的随机数。

我们可以通过将抖动值乘以逻辑来解决此问题 是否n() > 1 .如果为假，它将乘以 0;如果为 true，则为 1。

df %>%
    group_by(Tissue, value) %>%
    mutate(
        jitter = value + runif(n(), min = -0.15, max = 0.15) * (n() > 1)
    )
#       value Tissue     jitter
#       (dbl) (fctr)      (dbl)
# 1  1.051552    Vis  1.1020925
# 2  1.051552    Vis  1.1398244
# 3  1.051552    Vis  0.9339355
# 4 11.976925 Testes 11.9769250
# 5  1.051552    Vis  1.1186657
# 6  1.051552 Spleen  1.0515524
# 7  1.051552    Vis  1.0249348
# 8  1.051552  Brain  1.0814222
# 9  1.051552  Brain  1.0496148

在单个条件下，您实际上可以使用普通if(){} else，这也可以在mutate中工作：

jitter = value + if(n() > 1) {runif(n(), -.15, .15)} else 0

你

喜欢哪个取决于你。