从PosixPath，Python读取DICOM对象

Question

我有20,000个PosixPath，每个指向不同的.dcm对象。我需要逐个读取 .dcm 对象。这是我到目前为止的代码：

from pathlib import Path
import glob
import dicom
data = Path('/data')
path_to_dcm_objects = list(data.glob('**/*.dcm'))
for i in len(path_to_dcm_objects):
record = dicom.read_file(path_to_dcm_objects[i])

当我想使用其 PosixPath 读取 .dcm 文件时，我收到错误：

AttributeError: 'PosixPath' object has no attribute 'read'

任何帮助将不胜感激。

Answer 1

dicom.read_file()需要一个打开的文件对象或一个字符串作为路径而不是Path实例。如果它不是字符串，它会将其视为打开的文件并尝试从中读取。

将Path实例转换为字符串，str(path_object)：

for i in len(path_to_dcm_objects):
record = dicom.read_file(str(path_to_dcm_objects[i]))

将Path对象转换为字符串的帮助：

返回路径的字符串表示形式，适用于 传递给系统调用。

您还可以使用：

path_object.as_posix()

这为您提供了一个 Posix 路径：

返回带有正向 (/) 的路径的字符串表示形式 斜线。

顺便说一句，遍历所有路径的pythonic方式看起来更像这样：

for path_obj in data.glob('**/*.dcm'):
record = dicom.read_file(str(path_obj))