r-用列平均值替换缺失的值



我不知道如何在每列上循环,用列平均值替换NA值。当我试图用以下内容替换一列时,效果很好。

Column1[is.na(Column1)] <- round(mean(Column1, na.rm = TRUE))

在列上循环的代码不起作用:

for(i in 1:ncol(data)){
    data[i][is.na(data[i])] <- round(mean(data[i], na.rm = TRUE))
}

这些值不会被替换。有人能帮我做这个吗?

一个相对简单的代码修改应该可以解决这个问题:

for(i in 1:ncol(data)){
  data[is.na(data[,i]), i] <- mean(data[,i], na.rm = TRUE)
}

如果DF是数字列的数据帧:

library(zoo)
na.aggregate(DF)

添加:

仅使用R的基来定义一个函数,该函数对一列执行此操作,然后覆盖到每列:

NA2mean <- function(x) replace(x, is.na(x), mean(x, na.rm = TRUE))
replace(DF, TRUE, lapply(DF, NA2mean))

如果可以覆盖输入,最后一行可以替换为以下内容:

DF[] <- lapply(DF, NA2mean)

dplyrmutate_allmutate_at在这里可能很有用:

library(dplyr)                                                             
set.seed(10)                                                               
df <- data.frame(a = sample(c(NA, 1:3)    , replace = TRUE, 10),           
                 b = sample(c(NA, 101:103), replace = TRUE, 10),                            
                 c = sample(c(NA, 201:203), replace = TRUE, 10))                            
df         
#>     a   b   c
#> 1   2 102 203
#> 2   1 102 202
#> 3   1  NA 203
#> 4   2 102 201
#> 5  NA 101 201
#> 6  NA 101 202
#> 7   1  NA 203
#> 8   1 101  NA
#> 9   2 101 203
#> 10  1 103 201
df %>% mutate_all(~ifelse(is.na(.x), mean(.x, na.rm = TRUE), .x))          
#>        a       b        c
#> 1  2.000 102.000 203.0000
#> 2  1.000 102.000 202.0000
#> 3  1.000 101.625 203.0000
#> 4  2.000 102.000 201.0000
#> 5  1.375 101.000 201.0000
#> 6  1.375 101.000 202.0000
#> 7  1.000 101.625 203.0000
#> 8  1.000 101.000 202.1111
#> 9  2.000 101.000 203.0000
#> 10 1.000 103.000 201.0000
df %>% mutate_at(vars(a, b),~ifelse(is.na(.x), mean(.x, na.rm = TRUE), .x))
#>        a       b   c
#> 1  2.000 102.000 203
#> 2  1.000 102.000 202
#> 3  1.000 101.625 203
#> 4  2.000 102.000 201
#> 5  1.375 101.000 201
#> 6  1.375 101.000 202
#> 7  1.000 101.625 203
#> 8  1.000 101.000  NA
#> 9  2.000 101.000 203
#> 10 1.000 103.000 201

使用imputeTS包也有快速解决方案:

library(imputeTS)
na_mean(yourDataFrame)

要添加到备选方案中,使用@akrun的样本数据,我将执行以下操作:

d1[] <- lapply(d1, function(x) { 
  x[is.na(x)] <- mean(x, na.rm = TRUE)
  x
})
d1

lapply可以代替for循环使用。

d1[] <- lapply(d1, function(x) ifelse(is.na(x), mean(x, na.rm = TRUE), x))

与for循环相比,这并没有任何优势,但如果您也有非数字列,在这种情况下可能会更容易

d1[sapply(d1, is.numeric)] <- lapply(d1[sapply(d1, is.numeric)], function(x) ifelse(is.na(x), mean(x, na.rm = TRUE), x))

几乎同样容易。

使用tidyr的replace_na的一行是

library(tidyr)
replace_na(mtcars,as.list(colMeans(mtcars,na.rm=T)))

如果您的df中有非数字列,那么这需要比一行多做一点工作。

mean_to_fill <- select_if(ungroup(df), is.numeric) %>%
 colMeans(na.rm=T)
bind_cols(select(df, group1, group2, group3),
          select_if(ungroup(df), is.numeric) %>% 
            tidyr::replace_na(as.list(mean_to_fill))
          ) 

您也可以尝试:

 cM <- colMeans(d1, na.rm=TRUE)
 indx <- which(is.na(d1), arr.ind=TRUE)
 d1[indx] <- cM[indx[,2]]
 d1  

数据

set.seed(42)
d1 <- as.data.frame(matrix(sample(c(NA,0:5), 5*10, replace=TRUE), ncol=10))

简单地使用Zoo,它将简单地用列值的平均值替换所有NA值:

library(zoo)
na.aggregate(data) 
# Lets say I have a dataframe , df as following -
df <- data.frame(a=c(2,3,4,NA,5,NA),b=c(1,2,3,4,NA,NA))
# create a custom function
fillNAwithMean <- function(x){
    na_index <- which(is.na(x))        
    mean_x <- mean(x, na.rm=T)
    x[na_index] <- mean_x
    return(x)
}
(df <- apply(df,2,fillNAwithMean))
   a   b
2.0 1.0
3.0 2.0
4.0 3.0
3.5 4.0
5.0 2.5
3.5 2.5

类似于@Thomas指出的答案,这也可以使用R:的ifelse()方法来完成

for(i in 1:ncol(data)){
  data[,i]=ifelse(is.na(data[,i]),
                  ave(data[,i],FUN=function(y) mean(y, na.rm = TRUE)),
                  data[,i])
}

其中,ifelse(TEST, YES , NO)的参数为:-

测试-要检查的逻辑条件

-如果条件为True ,则执行

-否则当条件为假时

CCD_ 10是R中用于计算x[]的子集的平均值的方法

使用data.table包,您可以使用set()函数并在列上循环,并用您选择的聚合或值替换NA或任何您喜欢的值(此处:均值):

require(data.table)
# data
dt = copy(iris[ ,-5])
setDT(dt)
dt[1:4, Sepal.Length := NA] # introduce NAs
# replace NAs with mean (or whatever function you like)
for (j in seq_along(names(dt))) {
  set(dt,
      i = which(is.na(dt[[j]])),
      j = j, 
      value = mean(dt[[j]], na.rm = TRUE))
}

除了Denis答案,您还可以直接使用dplyr来计算平均值。如果在要选择的列中添加前缀,则可以使用contains或ends/starts_with():

df <- df%>%
mutate_at(vars(starts_with("prefix_")), ####Select vars starting with "prefix_"
~replace_na(.x, mean(.x, na.rm = TRUE))) #### replace na with mean

R的tidyr包有一个专门用于此目的的功能:replace_na

meanvals <- as.list(colMeans(data, na.rm = TRUE))
data <- replace_na(data, meanvals)

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