我想让一个cron作业使用已经存在的名为my_env的anaconda python环境执行python脚本。我唯一能想到做的就是让 cron 作业运行一个名为 my_script.bash 的脚本，该脚本反过来激活 env，然后运行 python 脚本。

#!/bin/bash
source activate my_env
python ~/my_project/main.py

尝试从命令行执行此脚本不起作用：

$ sh scripts/my_script.bash
scripts/my_script.bash: 9: scripts/my_script.bash: source: not found

我需要做什么来确保激活正确的环境。可以像我 5 岁一样向我解释。

我最近从 canopy 切换到 Anaconda 正是为了摆脱在 cron 作业中激活 env 的麻烦。Anaconda基于PATH环境变量使这变得非常简单。(我使用的是miniconda而不是完整的Anaconds安装，但我相信anaconda应该以同样的方式工作(

我测试过两种不同的方法;

在python脚本中添加一个shebang，main.py

#!/home/users/user_name/miniconda2/envs/my_env/bin/python
将 PATH 添加到 crontab 的顶部

PATH=/home/users/user_name/miniconda2/envs/my_env/bin

更新：

杰罗姆的回答和巴里克的评论是正确的。我刚刚在需要pynco,需要完整 conda nco环境的 Conda 环境中使用上述方法被烧毁，例如通过从 cron 运行调用 conda 激活的 bash 脚本来解决ncks, ncrcat.。

经过大量的摆弄，我crontab用conda activate my_env激活我的 conda 环境，并在该环境中运行 Python 解释器。

注意我使用的是 Ubuntu 18.04。

背景

当 Anaconda 安装程序初始化 conda 时，它会在~/.bashrc文件的末尾附加一个代码段。每次用户以交互方式打开bash时，都会执行此文件。该代码段允许用户从bash运行conda命令(即conda activate my_env(。
Anaconda 安装程序 v2020.02 在 ~/.bashrc 中附加了以下conda片段：

# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/opt/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; then
    eval "$__conda_setup"
else
    if [ -f "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
        . "/opt/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
    else
        export PATH="/opt/anaconda3/bin:$PATH"
    fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<

路径/opt/anaconda3/替换为正确的引用：通常/home/USERNAME/anaconda3/ 。

问题所在

在crontab -e中采购~/.bashrc是行不通的(至少在 Ubuntu 上是行不通的(。

解释：

在 Ubuntu 上，~/.bashrc文件开头有以下(或类似(行：

# If not running interactively, don't do anything
[ -z "$PS1" ] && return

这意味着如果我们尝试在 crontab 中获取~/.bashrc文件，.bashrc文件的其余部分将不会执行，因为crontab没有交互式运行(请参阅有关此主题的另一篇文章(。这意味着即使我们获取~/.bashrc，上面提到的conda片段也永远不会被crontab执行。

_ 工作解决方案 _

我找到的解决方案是将conda片段复制到单独的文件中。

1. 将`conda`代码段从`~/.bashrc`复制到`~/.bashrc_conda`

将上面提到的代码片段复制到另一个文件，例如 ~/.bashrc_conda .

确保：

运行 cronjob 的用户有权读取此文件。
其他用户无法写入此文件(安全风险(。

2. 在`crontab -e`插入 2 行以运行`bash`而不是`sh`并获取`~/.bashrc_conda`

运行crontab -e并在 cronjob 之前添加以下 2 行：

SHELL=/bin/bash
BASH_ENV=~/.bashrc_conda

解释：

SHELL=/bin/bash意味着crontab将通过bash而不是sh(默认(运行 cronjobs。见帖子。
BASH_ENV=~/.bashrc_conda获取conda代码段，bash由chrontab运行。请参阅帖子和帖子。

3. 在`crontab -e`在所需的`.py`脚本执行之前插入 cronjob 行`conda activate my_env;`

在所需的 conda 环境中每天中午 12：30 执行的脚本的条目示例：

30 12 * * * conda activate my_env; python /path/to/script.py

请注意conda activate my_env;在运行 Python 解释器的命令之前。

______

___

瞧，它奏效了。

有什么缺点吗？

如果.bashrc中的conda代码段通过conda更新进行更新，它当然不会反映在单独的.bashrc_conda文件中。可能需要不时检查更新。

也可以在该 cronjob 的末尾附加; conda deactivate，但这可能是多余的。

不要叫sh，而是bash。 source是一个 bash 命令。

    - sh scripts/my_script.bash
    + bash scripts/my_script.bash

或者只是

    chmod +x scripts/my_script.bash
    ./scripts/my_script.bash

既然你加了巴什谢邦。

就我而言，当我运行这行 shell 脚本时，我遇到了此错误：source activate my_env

activate: No such file or directory

所以我把source activate my_env改成了source /path/to/conda/bin/activate my_env.然后它开始工作。

使用完整路径来连接 conda

对我有用的一个简单的解决方案是在 crontab 条目中指定 conda 的完整路径，并使用 conda run -n <env> 选项在所需的环境中执行命令。就我而言，我想在启动时启动一个命令，所以我的 crontab 条目如下所示：

@reboot ~/miniconda3/bin/conda run -n <env> <command>

其中<env>和<command>根据您自己的要求进行替换。

> 截至 2022 年 5 月，我只需使用 Windows 10 中的.bat来激活myenv，然后启动我的localhost或您需要的任何脚本：

@echo off
set CONDAPATH=C:UsersMyNameanaconda3
set ENVNAME=myenv
if %ENVNAME%==base (set ENVPATH=%CONDAPATH%) else (set ENVPATH=%CONDAPATH%envs%ENVNAME%)
call %CONDAPATH%Scriptsactivate.bat %ENVPATH%
call cd /d d:/mysite
python manage.py runserver 0.0.0.0:8000

<</div> div class="one_answers">

在某些情况下，这种方法可能更简单、更简洁：

查找 conda 环境的路径
conda env list
将其添加为 crontab 文件顶部的"PATH"：
PATH=/Users/your_user_name/opt/anaconda3/envs/your_env/bin

有关更多详细信息，请查看此内容教程(来源(

我认为 conda 已经改变，所以这些解决方案都不再适合我，除了 @James 发布的用于在 crontab 中指定 conda 完整路径的解决方案。

但是，有时我想从 crontab 运行一个完整的 bash 脚本，并在整个脚本中激活一个 conda 环境。为此，有效的解决方案是采购conda.sh ，正如@effecor在这里发布的那样：https://stackoverflow.com/a/65183109/1676378。

对我来说，这意味着将以下行添加到由 cron 调用的 bash 脚本的顶部：

source /home/chris/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh

您的 conda.sh 可能位于其他地方。

根本问题解释如下：https://github.com/conda/conda/issues/7980正如nehaljwani所写："默认情况下，函数不会导出以在子shell中可用.">

U只需要添加PATH并使用conda run -n命令

PATH=/root/miniconda3/envs/my_env/bin：/root/miniconda3/bin：/root/miniconda3/condabin：/usr/local/sbin：/usr/local/bin：/usr/sbin：/
usr/bin：/sbin：/bin：/usr/games：/usr/local/games：/snap/bin
5 0 * * * conda run -n my_env python ~/my_project/main.py

简单的解决方案

使用 Anaconda Env 运行 crontab 作业

_ 工作解决方案 _

1. 将`conda`代码段从`~/.bashrc`复制到`~/.bashrc_conda`

2. 在`crontab -e`插入 2 行以运行`bash`而不是`sh`并获取`~/.bashrc_conda`

3. 在`crontab -e`在所需的`.py`脚本执行之前插入 cronjob 行`conda activate my_env;`

___

瞧，它奏效了。

使用完整路径来连接 conda

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使用 Anaconda Env 运行 crontab 作业

_________ 工作解决方案 _________

1. 将conda代码段从~/.bashrc复制到~/.bashrc_conda

2. 在crontab -e插入 2 行以运行bash而不是sh并获取~/.bashrc_conda

3. 在crontab -e在所需的.py脚本执行之前插入 cronjob 行conda activate my_env;

___

瞧，它奏效了。

使用完整路径来连接 conda

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1. 将`conda`代码段从`~/.bashrc`复制到`~/.bashrc_conda`

2. 在`crontab -e`插入 2 行以运行`bash`而不是`sh`并获取`~/.bashrc_conda`

3. 在`crontab -e`在所需的`.py`脚本执行之前插入 cronjob 行`conda activate my_env;`