带有 CGAL 构建错误的 pyximport :未定义的符号"__gmpq_equal"



我运行的是Debian 8和Cython的打包安装(apt-get install Cython)

我正在用CGAL (www.cgal.org)编译我的.pyx文件,但返回错误:

import pyximport; pyximport.install()
from spaces import spaces_rectangle

importterror: Building module spaces failed: [' importterror:/home/scootie/.pyxbld/lib.linux - x86_64 2.7/空间。所以:未定义符号:__gmpq_equal n ']

与以下文件:

spaces.pyx

from libcpp.vector cimport vector
cdef extern from "cgal_spaces.hpp":
    cdef vector[vector[vector[double]]] wrap_spaces(vector[vector[double]])
def spaces_rectangle(vector[vector[double]] rect):
    return wrap_spaces(rect)

spaces.pyxbld:

def make_ext(modname, pyxfilename):
    from distutils.extension import Extension
    return Extension(name=modname,
                     sources=[pyxfilename],
                     include_dirs=['.'],
                     libraries=['CGAL'],
                     language='c++',
                     extra_compile_args=['-std=c++11'])

和cgal_spaces.hpp:

#include <CGAL/Exact_predicates_inexact_constructions_kernel.h>
#include <CGAL/Partition_traits_2.h>
#include <CGAL/Partition_is_valid_traits_2.h>
#include <CGAL/polygon_function_objects.h>
#include <CGAL/partition_2.h>
#include <cassert>
#include <list>
#include <vector>
{
    *CODE HERE*
}

我链接不当或遗漏一些明显的东西吗??

编辑:如果我在pyximport外部编译脚本,它的编译没有问题。

cython -a spaces.pyx
g++ -std=c++11 -shared -pthread -fPIC -fwrapv -O2 -Wall -fno-strict-aliasing -I/usr/include/python2.7 -o spaces.so spaces.c

似乎有一个链接错误在pyximport与gmp库。链接到所有外部库的正确方法是什么?

解决方案:

def make_ext(modname, pyxfilename):
    from distutils.extension import Extension
    return Extension(name=modname,
                 sources=[pyxfilename],
                 include_dirs=['.'],
                 libraries=['CGAL','gmp'],
                 language='c++',
         extra_compile_args=['-std=c++11','-DCGAL_ROOT="/path/to/CGAL-4.8.1"'])

我已经添加了gmp库到*。但解决方案在于将-DCGAL_ROOT放在"-std=c++11"之后。

gmp库可能不在库中,

strings -f /usr/lib/x86_64-linux-gnu/*.a |grep gmpq_equal

输出
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.a: __gmpq_equal
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgmp.a: __gmpq_equal

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